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&&高质量DNA获取方法之月桂酸钠法(转)
高质量DNA获取方法之月桂酸钠法(转)
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高质量DNA获取方法之月桂酸钠法
从组织中获取DNA难吗?不难,真不难。高一就有开设的从鸡血中获取DNA的生物实验课,很简单的几步就可以得到DNA。但要想获取高质量的DNA,尤其是从一些富含多糖、多酚、淀粉、纤维和蛋白的组织,后面用于酶切、高通量测序大片段文库的构建,还是有一定的难度的。
最近协助北京农业生物技术研究中心一个老师提取桃叶片DNA还是遇到了一些困难,因为老师要做桃的个体重测序,因此对DNA的要求还是非常高的。之前跟其他很多老师交流植物DNA的提取,大多数目前仍然使用CTAB法,有些老师购买试剂盒进行提取,其实很多植物DNA提取试剂盒成分也是CTAB。CTAB法是提取植物DNA非常经典方法,但在提取的过程中由于要在65℃水浴中放置1个小时,因此耗时较长。我们在使用该法提取桃DNA时,获得DNA中含有大量的蛋白和多糖,虽然通过多次的苯酚氯仿抽提可以大部分去除,但DNA得率较低。在这里给大家分享一种快速获取植物高质量DNA的方法,供大家在提取植物DNA时作为参考,用该法提取的植物DNA完全满足后续酶切、BAC文库构建、高通量测序大片段文库构建,将该法称之为月桂酸钠法。
月桂酸钠抽提缓冲液:
Tris-Hcl(pH8.0)100mmol/L;NaCl 100mmol/L;EDTA(pH8.0)20mmol/L;月桂酸钠 1%;
配法:准确称取NaCl 5.844g,月桂酸钠 10g置于1000mL烧杯中,加入100ml Tris-Hcl(1M)以及40mLEDTA(0.5M)、800mlddH2O,用盐酸调节pH至8.0,定容至10000mL,灭菌后室温保存。
月桂酸钠英文名称:sodium lauroyl sarcosine&&分子式:C15H28NaO3N,分子量:293.39。
以该法大量获取玉米叶片DNA为例的实验流程:
& &(1)选取适量的玉米幼苗新鲜叶片,以纱布捆扎,做好标记,置于液氮中保存;
& &(2)研钵以液氮预冷,将玉米叶片置于研钵中,倒入液氮,迅速研磨至粉末级,期间时时加入液氮,防止研磨过程中DNA被降解;
& &(3)将研磨好的粉末移入灭菌后的50mL抽提试管中,用移液管加入10mL月桂酸钠抽提缓冲液,反复缓慢的摇匀;
& &(4)用移液管向50mL抽提试管中加入等体积(10mL)酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),反复缓慢的摇匀;
& &(5)12000 rpm,4°C离心20min后取出,小心吸取上清液16mL于新灭菌的50ml抽提试管中;
& &(6)向上述抽提试管中加入12mL异丙醇,上下缓慢颠倒数次,有白色絮状沉淀析出,颠倒时注意往一个方向,防止沉淀散开,不利于后续实验;
& &(7)将白色絮状沉淀用枪头从抽提试管中轻轻挑出,至于2mL EP管中;
& &(8)向上述2mL EP管中加入1.8mL70%乙醇,反复轻轻震荡洗涤,4°C,12000 rpm,高速离心15min,弃上清,重复此步骤两次;
& &(9)将得到的白色沉淀再次4°C,12000 rpm短暂离心数秒,以移液器吸干残留乙醇;
& &(10)白色沉淀置于37°C干燥箱中,使残存的70%乙醇全部挥发干净,这个过程中要经常拿出观察,防止过度烘干,不利于后面溶解;
&&(11)待白色沉淀变透明后,向2mLEP管中加入0.9mLTE缓冲液(pH8.0),放置于65℃恒温箱中,期间轻微弹匀,使DNA充分溶解;
&&(12)DNA完全溶解后,加入5μL RNase(0.1mg/mL),置于37°C干燥箱中30min,消化RNA,取出3μL,以1%琼脂糖胶检测是否有RNA残留;
&&(13)待RNA消化完成后,向EP管中加入等体积(0.9mL)氯仿,轻轻摇匀;
&&(14)4°C,12000 rpm高速离心15min;
&&(15)吸取0.7mL上清置于1.5ml新EP管中,加入1/10体积(约0.07mL)NaAc(3M/L)溶液,轻轻摇匀;
(16)向上述EP管中加入等体积(0.7mL)异丙醇,轻轻摇匀后,于-20°C静置20min;
(17)4°C,12000 rpm高速离心15min,弃上清;
(18)将得到的白色沉淀以70%乙醇洗涤两次,去除残留的乙醇;
(19)白色沉淀置于37°C干燥箱中,使残存的70%乙醇全部挥发干净,该过程中要经常拿出观察,防止烘干过度,不利于后面溶解;
(20)待白色沉淀变透明,管中无残留的乙醇味后,加入200μL TE(pH8.0),于37°C干燥箱中溶解;
(21)待DNA完全溶解后,取出1μL,以分光光度计测定OD值,分装后于保存(-20°C)。
以该法获取的玉米叶片DNA电泳图如下:
& &&&DNA提取过程中常见问题及建议解决方案:
建议解决方案
洗脱产物的DNA量很少或没有
所提样品材料老化或反复冻融导致基因组DNA含量下降
应选择新鲜的样品材料,如新鲜血液、新鲜菌液、刚离体的动物组织或幼嫩的植物组织等,不能即时处理的样品应立即放入液氮或-70℃低温保存,以免DNA降解。
样品破壁或裂解不完全导致基因组DNA未充分释放
动、植物材料应在液氮中充分研磨匀浆,G+细菌、酵母等破壁较困难的样品应用溶菌酶、酵母破壁酶或机械方式协助破壁,不同样品的细胞破壁方式可参照前面的详细介绍。
样品量过多导致细胞裂解不充分
加样量过多使裂解液和样品混合不均匀,细胞裂解不充分。不同来源样品的加样量请参照详细操作步骤。
DNA吸附不充分
如在上吸附柱前末加无水乙醇,或用低浓度乙醇代替无水乙醇,则导致DNA不能充分沉淀,与硅胶膜吸附不彻底,因此应在样品裂解后加适量无水乙醇,再上吸附柱使DNA与硅胶膜充分吸附。
DNA洗脱不适当
洗脱液pH值过低会降低洗脱效率,应确保洗脱液pH值在7.0-8.5之间;洗脱体积若小于30μ,则不易完全浸透硅胶膜,使DNA不能全部洗脱下来,因此洗脱液体积应大于30 μl,同时如洗脱液体积过大,超过200μl,则所得的DNA浓度会降低,但DNA总量不会减少;洗脱时可将洗脱缓冲液在65-70℃水浴预热,加入洗脱液后在室温静置2-5分钟,可提高洗脱效率,提高基因组DNA的产量。
提取的基因组DNA有降解
选取的材料不新鲜或反复冻融,采集材料后未及时处理或末低温保存
陈旧血液、老化菌液等不新鲜的材料中,细胞凋亡导致DNA降解,或低温保存的样品反复冻融导致细胞破碎,内源核酸酶降解DNA,因此应选择新鲜的材料样品,不能及时处理则低温保存,运输过程中亦应使用干冰。
未能有效抑制内源核酸酶作用
某些DNase含量较丰富的动、植物组织样品应在液氮中研磨或匀浆,研磨过程中应随时补充液氮,并在样品末完全解冻前即加入含有抑制核酸酶作用的鳌合剂的裂解液。
操作过于剧烈导致DNA被机打断
预处理的样品加入细胞裂解液后,所有操作应尽量柔和,避免振荡、搅拌等剧烈机械力对DNA片段的损伤。
提取的基因组DNA中有RNA污染
实验过程中没有有效使用RNase A
应严格按照实验操作要求使用,即加入裂解液的同时加入20μl RNase A溶液,室温放置10分钟。
RNAase A可能失活
RNase A须在-20℃下保存,低温保存时RNase A比较稳定,不易失活,但如果反复冻融会导致RNase A降解失活,所以应妥善保存。
提取的基因组DNA不能顺利地进行后续试验
样品量过多导致细胞裂解不充分
样品量过多会使裂解液不能快速有效地与样品充分混合,从而导致样品裂解不彻底,残留大量蛋自、多糖、脂类等杂质,为后续的上吸附柱分离纯化造成影响。应加入适当量的样品材料,具体数量请参照详细操作步骤。
DNA在洗脱前有大量乙醇残留
有机溶剂乙醇可严重抑制内切酶、DNA聚合酶的活性,而在DNA过柱洗涤过程中需使用含有乙醇的漂洗液,因此在洗脱DNA前,—定要充分去除残留的乙醇,可重复离心,或将吸附柱置于室温或50℃温箱中烘干5-10分钟,再加洗脱液。
来源:/st151778/Article_105896.html 致谢!
我觉得可以。可能是胶的问题造成18、26s带没分开(胶浓度过大或制胶效果不好)。我们做的时候RNA有时浓度只有100多点,PCR结果也不错。但注意,浓度低则溶液体积小,只能重复2次了。Good luck:hand:,
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作者:tgbus整理 来源:网络 发布时间: 11:47
内容简介:等级 类型 名称 地点 1~5 良材 冰之碎晶 中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) 1~5 良材 风之碎晶 中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) 1~5 良材 亚拉戈蜗牛 中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) x22,y17 1~5 良材 枫树枝 中央林
中央林区:翡翠湖畔(Lv.5)
中央林区:翡翠湖畔(Lv.5)
亚拉戈蜗牛
中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) x22,y17
中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) x22,y17
中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) x22,y17
中央林区:翡翠湖畔(Lv.5) x22,y17
北部林区:私语巨木(Lv.5) x25,y27
北部林区:私语巨木(Lv.5) x25,y27
北部林区:私语巨木(Lv.5) x25,y27
北部林区:私语巨木(Lv.5) x28,y26
北部林区:私语巨木(Lv.5) x28,y26
北部林区:私语巨木(Lv.5) x28,y26
北部林区:私语巨木(Lv.5)
北部林区:私语巨木(Lv.5)
北部林区:黄蛇門:(Lv.5)
中萨纳兰:无刺盆地(Lv.10)
中萨纳兰:无刺盆地(Lv.10)  x20,y27
中萨纳兰:无刺盆地(Lv.10) x20,y27
中央林区:翠泪择伐区(Lv.10)
中央林区:翠泪择伐区(Lv.10) x27,y19
中央林区:翠泪择伐区(Lv.10) x27,y19
中央林区:翠泪择伐区(Lv.10) x27,y19
提诺尔卡槲寄生
中央林区:翠泪择伐区(Lv.10) x27,y19
拉诺西亚低地:灰舰风车群左(Lv.10)
拉诺西亚低地:雪松原沿岸地(Lv.10)
拉诺西亚低地:雪松原沿岸地(Lv.10)  x31,y16
拉诺西亚香橙
拉诺西亚低地:雪松原沿岸地(Lv.10)  x31,y16
北部林区:艾&塔塔哨塔左上(Lv.10)
北部林区:艾&塔塔哨塔左上(Lv.10)
北部林区:私语巨木(Lv.10)  x28,y24
北部林区:私语巨木(Lv.10)  x28,y24
提诺尔卡槲寄生
北部林区:私语巨木(Lv.10)  x28,y24
食人魔南瓜
西萨纳兰:丰饶神井(Lv.15)  x22,y22
西萨纳兰:丰饶神井(Lv.15)  x22,y22
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西萨纳兰:丰饶神井(Lv.15)  x22,y22
西萨纳兰:地平(Lv.15)  x23,y19
库尔札斯胡萝卜种子
西萨纳兰:地平(Lv.15)  x23,y19
西萨纳兰:地平(Lv.15)  x23,y19
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中萨纳兰:执掌峡谷(Lv.15)  
中萨纳兰:执掌峡谷(Lv.15)  x26,y20
高山萝卜沙拉
中萨纳兰:执掌峡谷(Lv.15)  x26,y20
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拉诺西亚莴苣
中萨纳兰:盛夏滩沿岸(Lv.15)  x22,y19
红宝石番茄
中萨纳兰:盛夏滩沿岸(Lv.15)  x22,y19
中萨纳兰:盛夏滩沿岸(Lv.15)  x22,y19
中萨纳兰:盛夏滩沿岸(Lv.15)  x22,y19
中央林区:弯枝(Lv.15)
中央林区:弯枝(Lv.15)  x18,y18
中央林区:弯枝(Lv.15)  x18,y18
中央林区:弯枝(Lv.15)  x18,y18
中央林区:弯枝(Lv.15)  x20,y20
中央林区:弯枝(Lv.15)  x20,y20
中央林区:弯枝(Lv.15)  x21,y24
中央林区:弯枝(Lv.15)  x21,y24
中央林区:弯枝(Lv.15)  x21,y24
中央林区:弯枝(Lv.15)  x21,y24
中央林区:弯枝牧场下(Lv.15)
中央林区:地母神忘迹(Lv.15)
拉诺西亚低地:莫拉比湾西岸(Lv.15)
拉诺西亚低地:莫拉比湾西岸(Lv.15)  x27,y22
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拉诺西亚低地:莫拉比湾西岸(Lv.15)  x27,y22
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拉诺西亚低地:莫拉比湾西岸(Lv.15)  x27,y22
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南萨纳兰:丰饶神井(Lv.15)
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西拉诺西亚:四分石地(Lv.20)  x31,y28
西拉诺西亚:四分石地(Lv.20)  x31,y28
西拉诺西亚:骷髅谷(Lv.20)
1级碳化暗物质
西拉诺西亚:骷髅谷(Lv.20)
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中萨纳兰:黑尘(Lv.20)
中萨纳兰:黑尘(Lv.20)  x20,y20
拉诺西亚低地:灰舰风车群(Lv.20)
拉诺西亚低地:雪松原(Lv.20)  x34,y16
东萨纳兰:沙门(Lv.20)
东萨纳兰:沙门(Lv.20)  x16,y26
东萨纳兰:沙门(Lv.20)  x16,y26
东部林区:九藤(Lv.20)
东部林区:九藤(Lv.20)
东部林区:九藤(Lv.20)  x15,y26
东部林区:九藤(Lv.20)  x15,y26
东部林区:九藤(Lv.20)  x15,y26
东部林区:九藤(Lv.20)  x17,y29
东部林区:九藤(Lv.20)  x17,y29
东部林区:九藤(Lv.20)  x17,y29
拉诺西亚高地:橡树原(Lv.25)
拉诺西亚高地:橡树原(Lv.25)  x11,y24
拉诺西亚高地:橡树原(Lv.25)  x11,y24
拉诺西亚高地:橡树原(Lv.25)  x11,y24
仙子梅种子
拉诺西亚高地:橡树原(Lv.25)  x11,y24&&&&&&
东萨纳兰:枯骨(Lv.25)
阿拉米格芥末种子
东萨纳兰:枯骨(Lv.25)  x14,y20&&&
东萨纳兰:枯骨(Lv.25)  x14,y20&&&
东萨纳兰:枯骨(Lv.25)  x14,y20&&&
东萨纳兰:枯骨(Lv.25)  x14,y20&&&
南部林区:高径(Lv.25)
南部林区:高径(Lv.25)  x23,y21&&&
南部林区:高径(Lv.25)  x23,y21&&&
诺菲卡槲寄生
南部林区:高径(Lv.25)  x23,y21&&&
南部林区:高径(Lv.30)
中萨纳兰:来生回廊右上(Lv.30)
中萨纳兰:来生回廊右上(Lv.30)
中萨纳兰:来生回廊右上(Lv.30)
2级碳化暗物质
中萨纳兰:无刺盆地(Lv.30)
中萨纳兰:无刺盆地(Lv.30)
中萨纳兰:无刺盆地(Lv.30)
2级碳化暗物质
中拉诺西亚:三星里弯陷(Lv.30)
中拉诺西亚:三星里弯陷(Lv.30)
中拉诺西亚:三星里弯陷(Lv.30)
中拉诺西亚:横断崖(Lv.30)
中拉诺西亚:横断崖(Lv.30)
中拉诺西亚:横断崖(Lv.30)
中央林区:弯枝(Lv.30)
中央林区:弯枝(Lv.30)
中央林区:弯枝(Lv.30)
2级碳化暗物质
中央林区:弯枝(Lv.30)
中央林区:最南南部林区(Lv.30)
沉默花坛(Lv.30)
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.30)
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.30)
2级碳化暗物质
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.30)
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.30)
东拉诺西亚:白鸥塔(Lv.30)
东拉诺西亚:白鸥塔(Lv.30)
南部林区:高径(Lv.30)
南部林区:高径(Lv.30)
2级碳化暗物质
南部林区:高径(Lv.30)
南部林区:石场水车右上(Lv.30)
南部林区:巴斯卡隆(Lv.30)
南部林区:巴斯卡隆(Lv.30)
南部林区:巴斯卡隆(Lv.30)
南部林区:沉默花坛(Lv.30)  x27,y19
陆行鸟之羽
南部林区:沉默花坛(Lv.30)  x27,y19
北部林区:桤木泉(Lv.30)
北部林区:桤木泉(Lv.30)  x22,y26
北部林区:桤木泉(Lv.30)  x22,y26
北部林区:桤木泉(Lv.30)  x22,y26
北部林区:桤木泉(Lv.30)  x22,y26
北部林区:和平苑(Lv.30)
北部林区:和平苑(Lv.30)
2级碳化暗物质
北部林区:和平苑(Lv.30)
北部林区:和平苑(Lv.30)
北部林区:和平苑(Lv.30)
北部林区:和平苑(Lv.30)
北部林区:秋瓜浮村东(Lv.30)
低径(Lv.35)
东拉诺西亚:摇动房子(Lv.35)
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.35) x27,y30
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.35) x27,y30
中原罗勒草
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.35) x27,y30
东拉诺西亚:鲜血滨(Lv.35) x27,y30
南萨纳兰:秽水(Lv.35)
南萨纳兰:秽水(Lv.35)  x20,y9
沙漠番红花
南萨纳兰:秽水(Lv.35)  x20,y9
南萨纳兰:秽水(Lv.35)  x20,y9
南部林区:枯骨营地(Lv.35)
南部林区:枯骨营地(Lv.35)  x16,y28
南部林区:枯骨营地(Lv.35)  x16,y28
南部林区:枯骨营地(Lv.35)  x16,y28
南部林区:低径(Lv.35)  
南部林区:低径(Lv.35)    x16,y31
南部林区:低径(Lv.35)    x16,y31
南部林区:低径(Lv.35)    x16,y31
中央林区:白狼门下(Lv.40)
中央林区:白狼门下(Lv.40)
2级碳化暗物质
中央林区:白狼门下(Lv.40)
中央林区:白狼门下(Lv.40)
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x19,y25
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x19,y25
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x19,y25
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x19,y25
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x20,y29
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x20,y29
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.40)    x20,y29
南部林区:低径(Lv.40)
南部林区:低径(Lv.40)    x20,y30
血红奇异果挞
南部林区:低径(Lv.40)    x20,y30
南部林区:无限城古堡左(Lv.40)  
南部林区:无限城古堡左(Lv.40)  
2级碳化暗物质
南部林区:无限城古堡左(Lv.40)  
南部林区:无限城古堡左(Lv.40)  
北部林区:格尔莫拉遗迹(Lv.40)  
北部林区:格尔莫拉遗迹(Lv.40)  
2级碳化暗物质
北部林区:格尔莫拉遗迹(Lv.40)  
北部林区:格尔莫拉遗迹(Lv.40)  
库尔札斯中央高地:白云崖(Lv.45)  
库尔札斯中央高地:白云崖(Lv.45)    x23,y18 
提诺尔卡槲寄生
库尔札斯中央高地:白云崖(Lv.45)    x23,y18 
拉诺西亚高地:石绿湖(Lv.45)
撒沟厉鼠尾草
拉诺西亚高地:石绿湖(Lv.45)    x34,y24
拉诺西亚高地:石绿湖(Lv.45)    x34,y24
拉诺西亚高地:石绿湖(Lv.45)    x34,y24
拉诺西亚高地:石绿湖(Lv.45)    x34,y24
中萨纳兰:邪嗣右(Lv.50)
中萨纳兰:邪嗣右(Lv.50)
3级碳化暗物质
中萨纳兰:执掌峡谷(Lv.50)
中萨纳兰:执掌峡谷(Lv.50)
3级碳化暗物质
中萨纳兰:盛夏滩(Lv.50)
中萨纳兰:盛夏滩(Lv.50)
中萨纳兰:海词石窟下(Lv.50)
中萨纳兰:海词石窟下(Lv.50)
东拉诺西亚:太阳海岸(Lv.50)
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.50)
3级碳化暗物质
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.50)
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.50)
东拉诺西亚:接雨草树林(Lv.50)
东部林区:荆棘森(Lv.50)    x15,y23
东部林区:荆棘森(Lv.50)    x15,y23
东部林区:荆棘森(Lv.50)
南萨纳兰:红迷宫(Lv.50)
萨纳兰茶叶
南萨纳兰:红迷宫(Lv.50)    x14,y31
南萨纳兰:红迷宫(Lv.50)    x14,y31
摩杜纳(Lv.50) &详见未知采集点一览
摩杜纳(Lv.50) &详见未知采集点一览
摩杜纳(Lv.50) &详见未知采集点一览
摩杜纳(Lv.50) &详见未知采集点一览
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库尔札斯中央高地(Lv.50) &详见未知采集点一览
萨维奈槲寄生
库尔札斯中央高地(Lv.50) &详见未知采集点一览
库尔札斯中央高地(Lv.50) &详见未知采集点一览
4级碳化暗物质
摩杜纳(Lv.50) &详见未知采集点一览
东萨纳兰(Lv.50) &详见未知采集点一览
泽梅尔番茄
东拉诺西亚(Lv.50) &详见未知采集点一览
东拉诺西亚(Lv.50) &详见未知采集点一览
东拉诺西亚(Lv.50) &详见未知采集点一览
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东部林区(Lv.50) &详见未知采集点一览
东部林区(Lv.50) &详见未知采集点一览
东部林区(Lv.50) &详见未知采集点一览>>>>上古世纪月桂叶怎么采集?上古世纪月桂叶获得来源
上古世纪月桂叶怎么采集?上古世纪月桂叶获得来源
18:02:12 条 来源:上古世纪论坛 作者:虚幽末
  怎么?上古世纪月桂叶获得来源
  上古世纪月桂叶获得有1个来源:采集茂盛的月桂树时可以获得。花费劳动力10点,采集获得3-4个月桂叶,月桂树可以在商店购买种植,也可以在野外找到。
月桂 双冠丘陵分布图 上古世纪西大陆
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