SPSS Rspss聚类分析步骤怎么用相似度做横坐标

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【求助/交流】eric pcr 电泳,怎么计算,然后spss聚类分析
各位师兄、师姐:
& &&&你们好!请赐教--我已经跑了eric pcr电泳图谱,根据跑的marker,用quantity one 计算出了每个条带的大小(bp),用怎么处理数据才能在spss里进行聚类分析。spss里每个变量按顺序放吗?没有条带的就用0补?麻烦谁能传一份spss的文件给我看看,或者excel里排好的也行。我是这样排的,如图。
看到其他网站上说分析RAPD的电泳结果,首先计算bsr,即带纹相似率,然后在此基础上得出遗传距离,再聚类!我觉得ericr也应该这样,请问怎么算出bsr,即带纹相似率,怎么在此基础上得出遗传距离,分别用什么软件?谢谢各位了
回复也可以,发我邮箱也行。
Originally posted by gaoyu_8848 at
各位师兄、师姐:
& &&&你们好!请赐教--我已经跑了eric pcr电泳图谱,根据跑的marker,用quantity one 计算出了每个条带的大小(bp),用怎么处理数据才能在spss里进行聚类分析。spss里每个变量按顺序放吗?没 ... 关于相似性系数, 计算公式如下:
S = 2NAB/ ( NA + NB)
其中NAB为两基因型共有扩增带, NA 为基因型A
拥有的扩增带, NB 为基因型B 拥有的扩增带
遗传距离D (D一1一F) 您好,我想问一下您的ERIC-PCR体系及扩增温度设置条件。我也是做ERIC聚类,但是做了四个月了还是不大理想。我是25微的体积,缓冲液2.5微,镁1.5微,dNTP微,引物1微,酶0.5微。95℃,4,95℃,30s;65℃,172℃,172℃,10min.30个循环。 : Originally posted by jingrong978 at
您好,我想问一下您的ERIC-PCR体系及扩增温度设置条件。我也是做ERIC聚类,但是做了四个月了还是不大理想。我是25微的体积,缓冲液2.5微,镁1.5微,dNTP微,引物1微,酶0.5微。95℃,4,95℃,30s;65℃,172 ... 同跪求,我也是这个情况,做了好久都没什么结果
var cpro_id = 'u1216994';
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3秒自动关闭窗口spss做R型聚类分析时,横坐标为距离5,10,但我想得到横坐标为相关系数聚类分析,应该怎么做_百度知道
spss做R型聚类分析时,横坐标为距离5,10,但我想得到横坐标为相关系数聚类分析,应该怎么做
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