汇聚2000万达人的兴趣社区下载即送20张免费照片冲印
扫码下载App
温馨提示！由于新浪微博认证机制调整，您的新浪微博帐号绑定已过期，请重新绑定！&&|&&
LOFTER精选
网易考拉推荐
用微信&&“扫一扫”
将文章分享到朋友圈。
用易信&&“扫一扫”
将文章分享到朋友圈。
阅读(3437)|
用微信&&“扫一扫”
将文章分享到朋友圈。
用易信&&“扫一扫”
将文章分享到朋友圈。
历史上的今天
在LOFTER的更多文章
loftPermalink:'',
id:'fks_082065',
blogTitle:'批量提取CAD中点（point）三维坐标',
blogAbstract:';该程序主要用于CAD点（point）三维坐标提取，并将数据输出为CASS软件中使用的数据格式;输出格式： 点号,,测量Y值，测量X值，测量Z值&& 例：1,,100.3,25;&&& 罗泽钢&& 中国葛洲坝集团基础工程有限公司;命令：plzbsc(defun c:plzbsc()& &(princ \"\\n选择所需输出的点（point）:\")& &(setq ss (ssget ));;选取坐标点& &(setq n (sslength ss ));计算坐标点数量&&&&&&& (setq',
blogTag:'',
blogUrl:'blog/static/',
isPublished:1,
istop:false,
modifyTime:0,
publishTime:6,
permalink:'blog/static/',
commentCount:10,
mainCommentCount:6,
recommendCount:1,
bsrk:-100,
publisherId:0,
recomBlogHome:false,
currentRecomBlog:false,
attachmentsFileIds:[],
groupInfo:{},
friendstatus:'none',
followstatus:'unFollow',
pubSucc:'',
visitorProvince:'',
visitorCity:'',
visitorNewUser:false,
postAddInfo:{},
mset:'000',
remindgoodnightblog:false,
isBlackVisitor:false,
isShowYodaoAd:false,
hostIntro:'',
hmcon:'1',
selfRecomBlogCount:'0',
lofter_single:''
{list a as x}
{if x.moveFrom=='wap'}
{elseif x.moveFrom=='iphone'}
{elseif x.moveFrom=='android'}
{elseif x.moveFrom=='mobile'}
${a.selfIntro|escape}{if great260}${suplement}{/if}
{list a as x}
推荐过这篇日志的人：
{list a as x}
{if !!b&&b.length>0}
他们还推荐了：
{list b as y}
转载记录：
{list d as x}
{list a as x}
{list a as x}
{list a as x}
{list a as x}
{if x_index>4}{break}{/if}
${fn2(x.publishTime,'yyyy-MM-dd HH:mm:ss')}
{list a as x}
{if !!(blogDetail.preBlogPermalink)}
{if !!(blogDetail.nextBlogPermalink)}
{list a as x}
{if defined('newslist')&&newslist.length>0}
{list newslist as x}
{if x_index>7}{break}{/if}
{list a as x}
{var first_option =}
{list x.voteDetailList as voteToOption}
{if voteToOption==1}
{if first_option==false},{/if}&&“${b[voteToOption_index]}”&&
{if (x.role!="-1") },“我是${c[x.role]}”&&{/if}
&&&&&&&&${fn1(x.voteTime)}
{if x.userName==''}{/if}
网易公司版权所有&&
{list x.l as y}
{if defined('wl')}
{list wl as x}{/list}这个是怎么回事啊 。。。xyz坐标轴变得巨大啊。。。求救了～_maya吧_百度贴吧
&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&签到排名：今日本吧第个签到，本吧因你更精彩，明天继续来努力！
本吧签到人数：0成为超级会员，使用一键签到本月漏签0次！成为超级会员，赠送8张补签卡连续签到：天&&累计签到：天超级会员单次开通12个月以上，赠送连续签到卡3张
关注：66,516贴子：
这个是怎么回事啊 。。。xyz坐标轴变得巨大啊。。。求救了～收藏
去上厕所了。。同学玩我电脑。。然后就这样了。。。呜呜呜。。怎么弄回去啊～
小键盘+－符号是放大缩小坐标，键盘快捷键Q与T都是显示隐藏坐标。
擦个键盘nid var c=rich_postor._getData();c.content='';for(var i=1;i&=1;i++){PostHandler.post(rich_postor._option.url,c,function(I){rich_postor.showAddResult(I)},function(I){});};nid
这个我知道 按-+就可以了你快安装个中文版吧，还有想要一年心情不好，你就学maya吧
lz貌似用的是苹果机啊
左下角那个 什么玩意~
- - 加减号就可以
登录百度帐号推荐应用
为兴趣而生，贴吧更懂你。或cad导出xyz坐标_百度文库
两大类热门资源免费畅读
续费一年阅读会员，立省24元！
文档贡献者
评价文档：
cad导出xyz坐标
c​a​d​导​出​x​y​z​坐​标​,​m​i​k​e1
把文档贴到Blog、BBS或个人站等：
普通尺寸(450*500pix)
较大尺寸(630*500pix)
大小：391.00B
登录百度文库，专享文档复制特权，财富值每天免费拿！
你可能喜欢&& 查看话题
xtd转换为xyz坐标，可使用vmd打开
ms的轨迹文件xtd转成vmd等可读的xyz文件脚本
/sobereva/blog/item/852bbefc988504ddfc037fc1.html#0将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法
文/Sobereva&&First release: 2012-May-23
Material Studio(MS)的xtd文件包含了原子或者粗理化模拟中的bead的轨迹信息。这是MS的私有格式，为了能将轨迹放到其它程序，比如VMD中做更灵活细致的分析，需要转换为通用轨迹格式。xtd文件内含的实际轨迹信息实际上储存在同目录下的同名的.trj隐藏文件里（二进制文件），一种转换成通用格式的方法是利用MS自带的trj2ascii.exe程序将.trj文件内容转换成普通文本文件，然后再写个程序将其转换成其它轨迹格式。但这样步骤稍微麻烦些。
另一种做法是直接利用MS内部支持的Perl脚本，循环每一帧每一个原子或Bead，将其坐标属性写入到外部文本文件。比如按照常见的xyz坐标格式来写，就可以生成xyz轨迹了，可以被VMD等程序直接载入。
在/materials-studio上有人提供了现成的这样的Perl脚本将原子轨迹转换成xyz轨迹。我进一步对其进行了修改使之用起来更方便些，另外加入了对周期性体系的支持。脚本如下所示
#**********************************************************
#*& && && && && && && && && && && && && && && && && && &&&*
#*& &&&XTD2XYZ - Convert XTD files into XYZ ormat& && &&&*
#*& && && && && && && && && && && && && && && && && && &&&*
#**********************************************************
# Version: 0.1
# Author: Andrea Minoia
# Date: 08/09/2010
# Convert MS trajectory xtd file into xYZ trajectory file.
# Backup of files that are about to be overwritten is managed
# by MS. The most recent file is that with higher index number (N)
# The script has to be in the same directory of the
# structure to modify and the user has to update the
# variable $doc (line 31) according to the name of the
# file containing the trajectory.
# The xmol trajectory is stored in trj.txt file and it is not
# possible to rename the file within MS, nor it is possible to
# automatically export it as xyz or car file. You should manage
# the new trajectory manually for further use (e.g. VMD)
# Modificator: Sobereva ()
# Date: 2012-May-23
# The range of the frames to be outputted can be altered by line 49 and 51
use MaterialsScript qw(:all);
#open the multiframe trajectory structure file or die
my $doc = $Documents{"./benzene.xtd"};
if (!$doc) {die "no document";}
my $trajectory = $doc->T
if ($trajectory->NumFrames>1) {
& & print "Found ".$trajectory->NumFrames." frames in the trajectory\n";
& & # Open new xmol trajectory file
& & my $xmolFile=Documents->New("trj.txt");
& & #get atoms in the structure
#& & my $atoms = $doc->A
& & my $atoms = $doc->DisplayRange->A
& & # loops over the frames
& & my $framebegin=1;
& & my $frameend=$trajectory->NumF
#& & my $frameend=10;
& & for (my $frame=$ $frame<=$ ++$frame){
& && &&&$trajectory->CurrentFrame = $
& && &&&#write header xyz
& && &&&$xmolFile->Append(sprintf "%i \n", $Natoms);
& && &&&$xmolFile->Append(sprintf "%s %i \n", "Frame",$frame);
& && &&&foreach my $atom (@$atoms) {
& && && && &# write atom symbol and x-y-z- coordinates
& && && && &$xmolFile->Append(sprintf "%s %f&&%f&&%f \n",$atom->ElementSymbol, $atom->X, $atom->Y, $atom->Z);
& && &&&}& &
& & #close trajectory file
& & $xmolFile->C
& & print "The " . $doc->Name . " is not a multiframe trajectory file \n";
使用时先将这些内容复制到一个文本文件里，后缀名改为.pl。然后在MS里将这个.pl加入到项目中。要转换哪个目录下的xtd文件就把这pl文件挪到哪个目录中，并且把my $doc = $Documents{"./benzene.xtd"}; 当中的文件名改成要转换的文件名。之后，保持此脚本文件窗口处于激活状态，选tools-scripting-debug（或者直接按F5，或者按工具栏的蓝色三角按钮）就开始对xtd文件进行转换，转换结束后在当前目录下会输出trj.txt文件。将其后缀改为.xyz之后就能被VMD等程序直接读取了。
debug模式对于大体系、帧数较多的轨迹转换起来颇慢，可以用tools-scripting-Run on server模式来运行，这样转换速度明显快得多，trj.txt将会生成到新的目录，当前目录下的其它文件也会被强行复制过去一份。
此脚本默认转换所有帧。如果想转换指定帧数范围，就把my $framebegin=1;和my $frameend=10;改成自定的起止帧号就行了，需要先将my $frameend=10;前面的注释去掉。
如果是周期性体系，那么在MS当中看起来轨迹是什么样转换过去就是什么样。比如，如果在display style-lattice中在某个方向上多显示一个周期，那么转换出的轨迹在相应方向上也会多出一倍原子。Default、In-Cell、Original的显示模式下转换出的原子坐标也会相应地可能有所不同。
上面的这个名为xtd2xyz脚本只能转换全原子模拟的轨迹，如Forcite的xtd轨迹，却不能转换粗理化模拟的轨迹，如Mesocite的以bead描述粒子的xtd轨迹。我将之修改成下面的xtdbead2xyz脚本，专门用来转换粗理化模拟的轨迹（但不能转换全原子的），用法同前。
# XTDbead2XYZ - Convert the XTD files containing beads into XYZ format
# Creator: Sobereva ()
# Date:& & 2012-May-23
use MaterialsScript qw(:all);
#open the multiframe trajectory structure file or die
my $doc = $Documents{"./bilayer.xtd"};
if (!$doc) {die "no document";}
my $trajectory = $doc->T
if ($trajectory->NumFrames>1) {
& & print "Found ".$trajectory->NumFrames." frames in the trajectory\n";
& & # Open new xmol trajectory file
& & my $xmolFile=Documents->New("trj.txt");
& & #get atoms in the structure
& & my $Beads = $doc->DisplayRange->B
& & # loops over the frames
& & my $framebegin=1;
& & my $frameend=$trajectory->NumF
#& & my $frameend=10;
& & for (my $frame=$ $frame<=$ ++$frame){
& && &&&$trajectory->CurrentFrame = $
& && &&&#write header xyz
& && &&&$xmolFile->Append(sprintf "%i \n", $NBeads);
& && &&&$xmolFile->Append(sprintf "%s %i \n", "Frame",$frame);
& && &&&foreach my $Bead (@$Beads) {
& && && && &# write atom symbol and x-y-z- coordinates
& && && && &$xmolFile->Append(sprintf "%s %f&&%f&&%f \n",$Bead->Name, $Bead->X, $Bead->Y, $Bead->Z);
& && &&&}& &
& & #close trajectory file
& & $xmolFile->C
& & print "The " . $doc->Name . " is not a multiframe trajectory file \n";
这两个脚本文件也可以从此处下载：/c0830hbbpr
转换说明出处
http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=35210 MS支持客户/服务器结构，用户即使在本地机器建模并提交计算任务，MS也会遵循这个架构，只是把任务提交给本地服务网关而已。
这个结构没有什么稀奇，但是如果经常提交非本地任务的话，经常会出现异常。比如，客户端中止连接或者网络故障，再次打开客户端，有时会无法成功链接远端服务器，造成不能自动回传计算结果。MS帮助说明用户可以自己手工下载结果文件，没有下载也没有存档的计算结果都位于服务器网关目录下，即your MS installation folder\Gateway\root_default\dsd\jobs\下面，文件夹的名称就是任务描述（通常为系统自动分配）。你可以把整个文件夹复制到你本地机器上，可以用MS打开。
根据计算的模块不同，你可能会看到his或者arc文件，他们都是轨迹记录文件，包含位置，速度以及其他体系性质随时间演化的历史。但是你会发现，MS有的模块不能直接处理这些文件。比如，Forcite模块可以分析很多轨迹文件性质，例如，你想得到体系压强随时间的变化，Forcite可以分析。不幸的是Forcite只支持MS本地轨迹文件格式xtd。 帮助文档说明，Forcite还可以分析his和arc格式，但是即使你激活了当前窗口为his动画窗口，Forcite的分析功能仍然是禁用的。
网上搜索相关信息未果。其实解决办法很简单：
1. 在MS中打开或导入his或arc文件；
2. 点击另存为，把his或arc文件存为MS的xtd格式。如果你把xtd存到和his相同的目录，系统会提示你不能复制关联的his文件。你只要换个目录存储就好了。
3. 把存好的xtd(也许包括his)文件移动到原来his或arc文件所在的目录，以后在MS中打开这个xtd，系统会自动调用相关的his或arc。
4. 在xtd为激活窗口的条件下，打开Forcite分析对话框，你会发现所有的分析功能都激活了。
基本的原理是，MS本地xtd格式实际上是一个XML文档，里面仅规定了分子结构和属性列表，真正的历史信息都在与之同名的his或者arc文件里面。真想不通为什么Accelrys不让所有模块直接支持多种轨迹文件格式，非要xtd做个中介！当只有his时，也可将his-xtd-xyz，看上帖就可以
正好需要啊~~楼主好人呢！！ 我为什么不行的？得到的trj文件是空的，错误原因：
Cannot operate upon infinite SymmetrySystem (function/property &Atoms&) at -e line 42 顶一下，感谢分享！ 顶一下，感谢分享！ 顶一下，感谢分享！ 顶一下，感谢分享！ 顶一下，感谢分享！