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白手起家, 积分 27, 距离下一级还需 173 积分
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文件p中有10个字符
从文件p中读取字符作为特殊字符
在文件f.gff.gz
&NP_ arylamine N-acetyltransferase 2 [Homo sapiens]
MDIEAYFERIGYKNSRNKLDLETLTDILEHQIRAVPFENLNMHCGQAMELGLEAIFDHIVRRNRGGWCLQVNQLLYWALT
TIGFQTTMLGGYFYIPPVNKYSTGMVHLLLQVTIDGRNYIVDAGSGSSSQMWQPLELISGKDQPQVPCIFCLTEERGIWY
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YRKFNYKDNTDLVEFKTLTEEEVEEVLRNIFKISLGRNLVPKPGDGSLTI
&(省略n行)
&NP_ medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial isoform a precursor [Homo sapiens]
MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRR
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&NP_ short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial isoform 1 precursor [Homo sapiens]
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VIAGHLLRSYRS
中去匹配特殊字符并输出到x文件里
若匹配的特殊字符为“NP_”
输出的结果为：
&NP_ short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial isoform 1 precursor [Homo sapiens]
MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLL
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LIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALA
LESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRL
VIAGHLLRSYRS
求各位大神帮帮忙 ，菜鸟在此谢谢咯
(10.01 KB, 下载次数: 1)
17:29 上传
&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp
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本帖最后由 sunzhiguolu 于
18:05 编辑
litter_kid
1.& 文件p中有10个字符, 请问 10 个字符指的是啥?
XP_
2.& 文件f.gff.gz 各段之间是否存在分隔符.
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1#10个字符串就如看到的一样，如：XP_
f.gff.gz如下：
&NP_ alpha-2-macroglobulin precursor [Homo sapiens]
MGKNKLLHPSLVLLLLVLLPTDASVSGKPQYMVLVPSLLHTETTEKGCVLLSYLNETVTVSASLESVRGNRSLFTDLEAE
NDVLHCVAFAVPKSSSNEEVMFLTVQVKGPTQEFKKRTTVMVKNEDSLVFVQTDKSIYKPGQTVKFRVVSMDENFHPLNE
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&NP_ arylamine N-acetyltransferase 2 [Homo sapiens]
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&NP_ medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial isoform a precursor [Homo sapiens]
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AWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCV
TEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNM
GQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAIS
FMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIY
EGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
&NP_ short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial isoform 1 precursor [Homo sapiens]
MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLL
AMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNG
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VIAGHLLRSYRS
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试下,perl -nle 'if(@ARGV){$h{$_}=1;next}$P=$h{$1}||0 if(/\A&(\S+)/);print if($P)' p f.gff.gz复制代码
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sunzhiguolu
谢谢大神，虽没达到预期效果，但我还是写出来了
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litter_kid
虽没达到预期效果
你这话是啥意思, 我的那个有问题吗?
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sunzhiguolu
木有结果，可能是我运行错了....
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litter_kid
你的运行环境是?
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sunzhiguolu
命令行的perl我不太会，现在老师教的都是在linux服务器下用vim编写脚本语句，所以我说运行有问题
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你再试下,#!/usr/bin/perl
open (my $fh, '&', shift);
my %hKeys = map { $_, 1} &$fh&;
close ($fh);
my $P
while (&&){
& && &&&$Print = $hKeys{$1} || 0 if (/\A&(\S+)/);
& && &&&print if ($Print);
}
复制代码君，已阅读到文档的结尾了呢~~
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450px*300px480px*400px650px*490px
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3秒自动关闭窗口perl中的模式匹配_百度知道perl正则表达式多行模式无法匹配问题 - 开源中国社区
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用perl脚本调用ant进行批量编译，希望编译之后列出编译失败的模块数量和列表，代码如下：
open MODLIST, && list.txt& or die &can't open list.txt:\n $!&;
$faild = 0;
while(&MODLIST&) {
$antmsg = `ant -Dmodel=$_ 2&&1`;
print &\n====ant message====\n$antmsg\n====ant message====\n&;
if($antmsg =~ &/^BUILD FAILED$/m&){
print &$_ build faild! check the antlog&;
push @faillist, $_;
close MODLIST;
print &$faild models failed&;
for(@faillist){
print &\n&;
& & &&开始想用system函数调用ant通过返回值确定是否成功，经过测试发现不论ant执行成功或是失败，system返回值始终为0.于是改用捕获ant输出的方式，但结果是“/^BUILD FAILED$/m”部分始终匹配不成功。在正则表达式工具中测试过模式和文本可以匹配。
& & 以下是list.txt中有两条记录时的执行结果：
D:\workspace\source\xxxx\test\uat-test&perl test.pl
====ant message==== Buildfile: D:\workspace\source\xxxx\test\uat-test\build.xml
BUILD FAILED D:\workspace\source\xxxx\test\uat-test\build.xml:80: The element type &path& mu st be terminated by the matching end-tag &&/path&&.
Total time: 0 seconds
====ant message====
====ant message==== Buildfile: D:\workspace\source\xxxx\test\uat-test\build.xml
BUILD FAILED D:\workspace\source\xxxx\test\uat-test\build.xml:80: The element type &path& mu st be terminated by the matching end-tag &&/path&&.
Total time: 0 seconds
====ant message==== 0 models failed
& & 请各位网友指点：
& & 1.为何system函数调用ant，不论执行结果成败始终返回0？
& & 2.为何/^BUILD FAILED$/m部分无法匹配
& & 多谢！
共有1个答案
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问题已解决，我的代码有bug：匹配模式上不应该加引号。
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正则表达式的新手经常将贪婪匹配和最小匹配理解错误。默认情况下，Perl 的正则表达式是“贪婪地”，也就是说它们将尽可能多地匹配字符。
正则表达式的新手经常将贪婪匹配和最小匹配理解错误。默认情况下，Perl 的正则表达式是“贪婪地”，也就是说它们将尽可能多地匹配字符。
下面的脚本打印出“matched defgabcdef”，因为它尽可能多地匹配模式，直至结尾的‘g’。
$data = 'abcdefgabcdefg';
$data =~ /abc(.+)g/i;
print &matched
要改变匹配特点，只须简单地在量词（加号[+]或星号[*]）后面加一个问号（?）即可。在上面的程序中把模式改为在‘+’之后包含一个‘?’。
$data =~ /abc(.+?)g/i;
输出变成“matched def”，因为模式不再贪婪，而在允许模式匹配的同时匹配最少数目的字符。
对于可能得到的匹配多于期望的匹配的情况，最小匹配是必要的。下面是一个例子：
$data = 'MSFT +5%
IBM +2% 4';
print &matched
&&&while ($data =~
/(w+).+$(d+)/g);
你可能期望这段代码给出两行输出，一行是 MSFT，另外一行是 IBM。但是它的输出却只有（不正确的）一行，“MSFT 4”。‘+’模式匹配它能匹配的所有字符，也就是“+5%
IBM +2%”。加一个‘?’将模式改为最小匹配就可以得到期望的结果。
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