寻找差异基因时，同ko号的基因如何处理？
同ko号的基因，表达量应该相加后再比较，还是仅保留log2FoldChange值较大的基因。
按时间排序
看差异表达一般fold change 选择2作为cutoff，这样准一些。不过还是看具体的目的。你完全可以先用fold change log2=2作为cutoff试一试，然后再放宽或者放窄。生物信息很多时候都是先有个整体思路，然后试着做，做着做着结果就出来了。
寻找差异基因时可以不关注这些基因是否注释到相同ko号，而直接用原始的所有基因去分析，这样获得的信息更完整。
取决于你的目的。KEGG Orthology 是以条目为单位的，这个时候同一条目下的表达量应该相加。如果你要以基因为单位，那就不要用KO号，Gene ID或者Symbol为单位去寻找就好了。我印象中KO貌似和symbol是一一对应的吧，能举出一个一对多的例子么？
回答的和我的想法差不多。谢谢他的评论，KO即KEGG Orthology。我的操作方法是，1）利用表达谱芯片或者RNA-seq寻找差异表达基因时，就是比较同一基因在不同条件下的表达差异，用Gene ID（如Refseq ID、Ensemble ID等）或者Gene Symbol（就是名字，如TP53）或者是probe ID（如芯片affy的ID，芯片illumina的ID）。2）当遇到多个转录本（transcript）对应同一个基因、可以分别做，也可以合并（collapse，取平均值或者是最大值）。3）找到差异表达基因之后，再与KO相对应，找到富集的pathway。（这步我是用DAVID网站作用，KEGG的底层没怎么操作过）
（如果你将原始基因视为不同的基因）表达量应当相加。
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由于每天整理产品时间比较长，个别限量或者限时的产品往往发布时候缺货或者结束，因此，在早上整理的时候，微博同步发布，大家可以看一下，不着急也可以等我整理出来一起看，因为多数都是10点左右抢购的，我的微薄地址
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超轻粘土24色28.8元，和以前推荐的牌子不一样，不过看着也不错，喜欢的看看吧
标王布鞋10元包邮，感觉不错，需要的下手要快，应该是10点开始
米奇车载香水1元包邮，数量不多，手快的朋友看看吧
厨房秤18元包邮，就价格很不错，需要的看看吧，这个还是比较实用的东西
决明子保健枕21元包邮，从评论来看反应非常好，决明子含量是200克，这种样子设计不错，需要的看看吧
杉杉的背心7.9元，价格不错，需要的看看吧
南极人精梳棉短袖T恤9.9元，这个价格感觉不错，精梳棉的夏天穿着比较舒服，注意这个是晚上8点开始
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佳尔美餐桌布 座椅套28元，这个介绍没看太明白，个人感觉应该是一个桌布，4个椅套，不过介绍的不清楚，建议咨询一下客服，如果是一套，感觉非常值，评论挺好的(注意，刚才问了，只有一个桌布，没有椅套，性价比一般了，大家注意下吧)
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雪纺连衣裙42元，拍下是这个价格，看着还成，价格不算太白菜，建议加上运费险
男款休闲裤35元，看着还成，单品评价不错，不过商家总体评价不好，另外这个材质不是棉的，化纤的，购买时候注意，强烈建议加上运费险
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床笠15元起包邮，价格感觉还不错，不过材质介绍不明，个人感觉应该不是纯棉的，用床笠感觉比较整齐，喜欢的看看吧
女款牛仔短裤18元，价格还可以，喜欢这种破洞风格的可以看看，个人不喜欢
女款短袖棉质T恤12元包邮，价格一般吧，样子还可以，喜欢的看看吧
苹果4手机套6.9元，价格不错，需要的看看吧
小米2硅胶套5.5元包邮，价格还可以，需要的看看吧
车载手机支架8元，看着还不错，不过夏天，这个用完尽量尽快拿下来，要不很容易晒坏，大家注意下吧
葡萄酒22元，价格不过，不过这种所谓的进口酒太乱，这个价格随便尝尝还成，不过估计东西一般
女童糖果色鞋16元不包邮，看样子不错，评论挺好的，不过不包邮，性价比就一般的，特别喜欢的朋友看看吧
女款纯棉短袖T恤9.9元，价格还不错，需要的看看吧，这个休闲或者在家穿挺好的
男款短袖纯棉T恤9.8元包邮，看着比较薄，不过在家随便穿穿映泰比较舒服，大家可以跟上面南极人的对比下
儿童布书8元包邮，价格一般吧，需要的看看吧，给小朋友玩玩不错
女童纯棉连衣裙19.6元，价格不错，看着挺好的，纯棉的穿着比较舒服，喜欢的看看吧
棉质钓鱼帽14元，看着还不错，评价挺好的，需要的哦看看吧
吊带包臀连衣裙16.8元，看着样子不错，不过材质是化纤，购买时候注意，需要的看看吧
男款棉麻格子衬衫16元，以前推将过，总体评论还不错，价格挺好，需要的看看吧
严迪牙膏3只25元，价格还不错，有一个赠品牙刷，总体评价挺好的，需要的看看吧
真皮男款凉鞋29元，价格不错，一般这个价位的鞋质量一般，不过这个看评价还不错，从图片看，应该是真皮没问题，注意这类凉鞋后面带的铆钉那容易坏，不过维修成本不高
儿童身高贴，墙贴4.9元，价格不错，评价不错，需要的看看吧11点开始
USB口小风扇8.9元，我现在电脑现在有一个，用着比较方便，需要的看看吧
摩卡咖啡豆27元454克，咖啡豆自己磨磨挺有意思的，有喜欢的看看吧，看评论反应不错
双层不锈钢保温杯18.9元，就挨个不错，总体评论还可以，这个价格个人觉得还不错
女款运动两件套35元，看着还成，需要的看看吧，建议加上运费险
家用手动绞菜机25.5元，价格一般，看评论还成，不过个人觉得，这种还是不如电动方便，估计这个绞肉不太成，大家仔细看看吧
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紫砂煲1.5升的25元，尺寸很小，给小朋友熬点东西可以，要是全家用肯定不够大，评价还不错，需要的看看吧
薄饼机44元，觉得试用性一般吧，不过做薄饼不错，看到这个让我想起了朝天锅，味道还是很不错的，弄个这个自己可以在家试试朝天锅，土豆丝卷饼啥的
迷你电煮锅32元包邮，价格还可以，样子还可以，这东西最合适的就是煮方便面，单位放一个还可以，需要的看看吧
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纯棉男款T恤27元包邮，价格一般吧，过看着还成，需要的看看吧
老粗布凉席39元，看着还成，高等级VIP应该会便宜比较多，需要的看看吧
慢回弹午睡枕24元，价格还可以吧，看评论还成，当普通枕头也可以，需要的看看吧，记忆棉初期会有些味道，通风处放放就好了
搪瓷水杯，送父母2个18元，价格还不错，我印象中我小时候都用这个，有点回忆的感觉，大概在750ml左右，喜欢的看看吧，评价不错
QQ玩偶28CM的15元，价格还可以吧，不过感觉像给腾讯做广告似的，喜欢的看看吧，注意回来看看里面填充材质
无纺布鞋柜49元，9层的，比较高，总体销量挺大，评价不错，需要的看看吧
儿童运动鞋27元，看着还成，价格不错，不过现在不是季节，小孩脚张的快，如果不是特别喜欢，建议等等
浪莎女款三角裤4.8元，价格不错，需要的看看吧
女款民族风格雪纺衫29元，样子还可以，不过新商家，没有评论，建议加上运费险
DIY相册9.9元，类似的以前推荐很多的，需要的看看吧
女童雪纺衫14.7元，看着个不错，价格挺好，不过没有评价，加上运费险吧
蓝牙耳机23元，价格还不错，不过这种不知名品牌，质量一般吧，购买时候注意啊
碧根果9.9元包邮，价格还可以吧，买一包尝尝还成，需要的看看吧 11点开始
昌义去屑洗发露9.9元，价格不算白菜，赵本山代言的，买一瓶试试效果也成，别多买 注意11点开始
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男童纯棉短袖T恤9.9元，价格不错，种类挺多，需要的看看吧，下午3点开始
安全锤9.9元，这个东西说实话感觉用处不大，上次我记得电视做过测试，用这个砸玻璃挺费事的，个人觉得，还是推荐那种便携铲子砸效果会更好些
儿童洗发帽5.8元，价格不错，需要的看看吧，下午3点开始
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名库的女款内裤5.5元包邮，价格不错，需要的看看吧 晚上8点开始
莫代尔抹胸3.8元包邮，价格不错，需要的看看吧，别多买
磨刀器6.5元，价格不错，需要的看看吧，这个挺好用
收纳两件套9.9元，价格不错，需要的看看吧
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电动轨道小火车9.9元包邮，价格不错，不过这种质量一般，随便玩玩还可以，要求高着慎拍 10点开始
遮阳帽9.9元，看着不错，11点开始，需要的看看吧
更多的VIP产品，有需要的看看吧，大家参照一下我帖子里的价格
5月27日今天vip，东西很多，大家仔细看看，注意，10点的时候好几款估计会非常快抢完，所以大家先订好目标
5月26日今天VIP，周末东西不多，有几样挺不错的，大家仔细看看吧，傲帝那个裤子挺好的，
5月25日今天vip，东西不少，大家仔细看看，有几样价格很不错，另外大家注意下，VIP特价的，高等级会更低，其他类型折扣的，跟等级没关系，
5月24日今天vip,东西很多，大家仔细看看，11点抢购的天堂铅笔伞下手一定要快，奥棉的背心很不错，另外其他不少东西也很超值
5月23日今天VIP，有几样商品价格特好，但是品质把握不太好，大家注意加上运费险，三奇的泳衣特价，V6用户最低是13.6元，非常值
5月22日今天vip，东西非常多，超值的也不少，不过大家注意看我写的说明，有些并不是推荐购买的
5月21日今天VIP,那个蚊帐不错，另外几款抢购的下手一定要快，估计最多1-2分钟就会没货
5月20日周一VIP，东西非常多，前面一些电器类的很多感觉非常好，比如69元双层豆芽机，另外东西太多
5月19日今天vip，周末东西不多，不过奥棉那几个非常超值，尤其是19元内衣套装，价格太给力了，下手一定要快，其他有不少也很不错
关于淘宝天猫的产品，我会尽量以天猫为主，淘宝一些感觉特别超值的也会推荐，但是不管天猫还是淘宝，商家众多，良莠不齐。我在选取的时候也会尽量去把关，不过希望大家多看一下我对商品的点评，因为这些商品都是在各方面感觉比较值的，但是没有实际购买，很多介绍只是看到商家的介绍和价格，另外就是商家总体信用来判断。没拿到具体商品，很多也说不好的，我一般会在有犹豫的产品后面加上建议增加运费险。建议大家这样的加上运费险，一般这种情况，不管天猫还是淘宝，正常退货应该是没问题的，损失的可以能是几毛钱的运费险费，淘宝淘宝，淘为主吧，另外，天猫的商品，如果商家超过3天不发货，如果东西不是特别看好的，就申请退款吧，因为根据天猫规定，超过3天不发货退款可以获得30%赔偿，当然不是说以这个来赚钱，只是给那些不负责的商家做些惩罚（不过建议先跟客服沟通下，看看他们是否有正常理由，上次我买那个傲帝的裤子发货就很慢，不过人家说确实销量大，而且主动送了条内裤，还是很不错的）(此文由-05-28 12:21:08编辑过)
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