可以帮我做一个spss做散点图图吗

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TCGA数据库制作的这个散点图,谁能帮我看一下~谢谢啊
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是研究肿瘤中两个基因的mRNA表达的相关性,我不明白的地方是(带红色箭头):1.分析是否有相关性用的是 Pearson’s correlation 和Spearman’s correlation 这两种方法,对吗?如果是的话为何要同时用两种方法来分析?2. 上方红色箭头处,Pearson 0.56 和Spearman 0.53 代表啥意思?如何解读这两个值代表的相关性大小?3.下方红色箭头处,表示我们提取的是RNA Seq技术测到的组织样本中的mRNA表达的数据,那么这个“RSEM”代表啥意思?
不知道邀请谁?试试他们
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answer to Q1-2:
Pearson 和Spearman是采用不同方法计算相关性的,Pearson 主要是线性,Spearman 是秩排序,两种都算就是双重说明,数字表示相关性系数,相关性系数在0-1之间,如果计算了correlation test还会有p值。answer to Q3:RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,TCGA的RNA-seq数据是采用的这种算法进行mRNA定量的。
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唐归来 answer to Q1-2:
Pearson 和Spearman是采用不同方法计算相关性的,Pearson 主要是线性,Spearman 是秩排序,两种都算就是双重说明,数字表示相关性系数,相关性系数在0-1之间,如果计算了correlation test还会有p值。answer to Q3:RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,TCGA的RNA-seq数据是采用的这种算法进行mRNA定量的。RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,我搜了一下没找到相关简介,能否简单地描述一下定量的最基本的原理?谢谢了。
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唐归来 answer to Q1-2:
Pearson 和Spearman是采用不同方法计算相关性的,Pearson 主要是线性,Spearman 是秩排序,两种都算就是双重说明,数字表示相关性系数,相关性系数在0-1之间,如果计算了correlation test还会有p值。answer to Q3:RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,TCGA的RNA-seq数据是采用的这种算法进行mRNA定量的。数字表示相关性系数我知道了,就是不知道系数大小和相关系大小之间的对应关系,例如:“相关性系数在0-1之间”是不是代表了有相关性呢,数值越大相关性越大?“相关性系数&0”是否就代表了没有相关性?另外,这个在线分析工具确实计算了correlation test,计算后的p值是&0.05的。这个结果代表了什么?相关性很大?很小?还是仅仅代表了定性地判断相关性的有无,对相关性大小判断不了?对这个结果看不明白啊。。请帮忙。。谢谢!
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zha_dian 唐归来 answer to Q1-2:
Pearson 和Spearman是采用不同方法计算相关性的,Pearson 主要是线性,Spearman 是秩排序,两种都算就是双重说明,数字表示相关性系数,相关性系数在0-1之间,如果计算了correlation test还会有p值。answer to Q3:RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,TCGA的RNA-seq数据是采用的这种算法进行mRNA定量的。数字表示相关性系数我知道了,就是不知道系数大小和相关系大小之间的对应关系,例如:“相关性系数在0-1之间”是不是代表了有相关性呢,数值越大相关性越大?“相关性系数&0”是否就代表了没有相关性?另外,这个在线分析工具确实计算了correlation test,计算后的p值是&0.05的。这个结果代表了什么?相关性很大?很小?还是仅仅代表了定性地判断相关性的有无,对相关性大小判断不了?对这个结果看不明白啊。。请帮忙。。谢谢!不好意思,之前可能说的不准确,相关系数在-1和1之间,负值代表负相关,正值代表正相关,绝对值越大相关性越大。correlation test的p值&0.05说明显著相关,一般卡相关系数+p值,
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zha_dian 唐归来 answer to Q1-2:
Pearson 和Spearman是采用不同方法计算相关性的,Pearson 主要是线性,Spearman 是秩排序,两种都算就是双重说明,数字表示相关性系数,相关性系数在0-1之间,如果计算了correlation test还会有p值。answer to Q3:RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,TCGA的RNA-seq数据是采用的这种算法进行mRNA定量的。RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,我搜了一下没找到相关简介,能否简单地描述一下定量的最基本的原理?谢谢了。RSEM描述paper:
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唐归来 zha_dian 唐归来 answer to Q1-2:
Pearson 和Spearman是采用不同方法计算相关性的,Pearson 主要是线性,Spearman 是秩排序,两种都算就是双重说明,数字表示相关性系数,相关性系数在0-1之间,如果计算了correlation test还会有p值。answer to Q3:RSEM是RNA-seq数据定量的一种算法,TCGA的RNA-seq数据是采用的这种算法进行mRNA定量的。数字表示相关性系数我知道了,就是不知道系数大小和相关系大小之间的对应关系,例如:“相关性系数在0-1之间”是不是代表了有相关性呢,数值越大相关性越大?“相关性系数&0”是否就代表了没有相关性?另外,这个在线分析工具确实计算了correlation test,计算后的p值是&0.05的。这个结果代表了什么?相关性很大?很小?还是仅仅代表了定性地判断相关性的有无,对相关性大小判断不了?对这个结果看不明白啊。。请帮忙。。谢谢!不好意思,之前可能说的不准确,相关系数在-1和1之间,负值代表负相关,正值代表正相关,绝对值越大相关性越大。correlation test的p值&0.05说明显著相关,一般卡相关系数+p值,非常感谢!
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zha_dian 是研究肿瘤中两个基因的mRNA表达的相关性,我不明白的地方是(带红色箭头):1.分析是否有相关性用的是 Pearson’s correlation 和Spearman’s correlation 这两种方法,对吗?如果是的话为何要同时用两种方法来分析?2. 上方红色箭头处,Pearson 0.56 和Spearman 0.53 代表啥意思?如何解读这两个值代表的相关性大小?3.下方红色箭头处,表示我们提取的是RNA Seq技术测到的组织样本中的mRNA表达的数据,那么这个“RSEM”代表啥意思?请问你知道这个图是怎么做出来的吗?下载哪些数据,用什么软件等等。我也在做这方面的研究,搞不懂。谢谢,望您不吝赐教
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zha_dian 是研究肿瘤中两个基因的mRNA表达的相关性,我不明白的地方是(带红色箭头):1.分析是否有相关性用的是 Pearson’s correlation 和Spearman’s correlation 这两种方法,对吗?如果是的话为何要同时用两种方法来分析?2. 上方红色箭头处,Pearson 0.56 和Spearman 0.53 代表啥意思?如何解读这两个值代表的相关性大小?3.下方红色箭头处,表示我们提取的是RNA Seq技术测到的组织样本中的mRNA表达的数据,那么这个“RSEM”代表啥意思?请问你知道这个图是怎么做出来的吗?下载哪些数据,用什么软件等等。我也在做这方面的研究,搞不懂。谢谢,望您不吝赐教
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