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&MS中Gulp模块下原子如何固定
MS中Gulp模块下原子如何固定
作者 li_jinchun
目前，通过MS中Gulp软件模拟界面问题。为了使计算简单，想把界面一侧的原子固定。所以在modifity中的constraints中勾上了Fix Cartesian position 和Fix fractional postion，但是所固定的原子的坐标仍然变化，而且变化较大。
请问这是什么原因，如何解决这一问题，谢谢！
x,y,z前面勾了没有啊？只勾选笛卡尔坐标就可以了吧？
引用回帖:: Originally posted by andong1988 at
x,y,z前面勾了没有啊？只勾选笛卡尔坐标就可以了吧？ 如果只勾了Cartesian x y z的话，原子仍会移动，而且移动较大，有时原子直接就散了。
引用回帖:: Originally posted by li_jinchun at
如果只勾了Cartesian x y z的话，原子仍会移动，而且移动较大，有时原子直接就散了。... 同求此问题，楼主解决了吗？
引用回帖:: Originally posted by li_jinchun at
没有，我使用了linux下的:Gulp,就解决了
... linux 下，gulp优化分子晶体，如何使分子保持刚性呢？
引用回帖:: Originally posted by liwl926 at
linux 下，gulp优化分子晶体，如何使分子保持刚性呢？... 模型只包含一个分子还是多个分子，只有一个就固定原子坐标。如果是多个分子，就得看情况而定，gulp没有那么智能。
引用回帖:: Originally posted by li_jinchun at
模型只包含一个分子还是多个分子，只有一个就固定原子坐标。如果是多个分子，就得看情况而定，gulp没有那么智能。... 刚刚接触GULP，一般分子晶体单胞内都会有多个分子，是否可以放开分子内的某一个原子，然后其他原子按内坐标与其相连并固定。如何操作呢？可否给个例子，多谢了，
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&【求助】求助MS 中的Gulp遇到的问题
【求助】求助MS 中的Gulp遇到的问题
作者 meimeinn
想请教MS中Gulp在fit Forcefield计算时，用到的A，rho, C 和rmax是如何得到的，恳请指教！ 怎样设置合金中的m,n,c,还有交互作用能
我也想学习gulp，哪里有好的教程呢？
这些参数是通过拟合得到的，合金的我也正在研究中
引用回帖:Originally posted by sg at
这些参数是通过拟合得到的，合金的我也正在研究中 想问一下你知道是哪个软件做的吗，
自己顶一下，请高人指教呀
楼主，可以请问哪里有Gulp的教程吗，能不能发一份，本人近期想学习学习，刚刚了解，还不太懂，还望多多指导
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与700万科研达人随时交流如何自己开发gulp插件？ - 知乎5被浏览417分享邀请回答// 引入插件需要的包
var through = require('through2');
// 定义gulp插件主函数
// prefix_text：调用插件传入的参数
module.exports = function gulp_prefix(prefix_text){
// 创建stream对象，每个文件都会经过这个stream对象
var stream = through.obj(function(file, encoding, callback){
// 文件经过stream时要执行代码
// 返回stream对象
return stream;
gulp插件的主函数需要返回一个stream对象。创建stream对象的方法有很多种，这里我使用through.obj来创建一个stream对象。调用through.obj时传入的函数参数最终会覆盖stream._transform函数，这里有必要讲解下这个函数怎么使用。transform._transform(file, encoding, callback)file：stream对象接收到的文件数据，该文件类型有三种：stream：流数据，可以用file.isStream判断buffer：二进制数据，gulp.src读取文件默认就是这个类型，可以用file.isBuffer判断null：为空，表示没有数据，可以用file.isNull判断encoding：表示编码方式，一般不用，可以不管callback(error,data)：回调函数，执行完代码后都要调用这个函数，告诉stream引擎，我们已经处理完了；这里说下callback(error,data)的使用:
error：错误信息；可省略
data：文件数据，可以传入file参数，或者undefined；可省略。好了，gulp插件的结构就是这么简单，现在介绍编写一个简单的插件来加深理解：gulp-prefix。开始编写gulp插件现在我们实现一个能在每个文件开头加上一段字符串功能的gulp插件，写插件之前先创建一个package.jsonnpm init
询问你name时，可以取名为：gulp-prefix，执行成功后，package.json的内容为：{
"name": "gulp-prefix",
"version": "1.0.0",
"description": "",
"main": "index.js",
"scripts": {
"test": "echo \"Error: no test specified\" && exit 1"
"author": "",
"license": "ISC"
在本地创建一个插件入口文件index.js文件，内容为：var through = require('through2');
module.exports = function gulp_prefix(prefix){
if(!prefix){
prefix = "";
// 引入插件需要的包
var through = require('through2');
// 定义gulp插件主函数
// prefix_text：调用插件传入的参数
module.exports = function gulp_prefix(prefix_text){
// 创建stream对象，每个文件都会经过这个stream对象
var stream = through.obj(function(file, encoding, callback){
// 文件经过stream时要执行代码
// 返回stream对象
return stream;
var prefix = new Buffer(prefix);
var stream = through.obj(function(file, encoding, callback){
// 如果file类型不是buffer 退出不做处理
if(!file.isBuffer()){
return callback();
// 将字符串加到文件数据开头
file.contents = Buffer.concat([prefix, file.contents]);
// 确保文件会传给下一个插件
this.push(file);
// 告诉stream引擎，已经处理完成
callback();
return stream;
现在插件的目录结构为：.
├── index.js
├── package.json
现在可以使用该插件了，将插件复制到你的gulp项目下node_modules/gulp-prefix目录中，编写gulpfile.js：var gulp = require('gulp'),
prefix = require('gulp-prefix');
gulp.task("default", function(){
gulp.src("src/*.js")
.pipe(prefix("prefix data"))
.pipe(gulp.dest("js"));
可以看到所有的js文件内容的前面都加上prefix data字符串现在插件已经开发好了，接下来介绍下关于如何测试插件的问题。gulp插件测试像很多项目需要单元测试一样，我们在开发gulp插件时，也需要有测试功能，接下来我教大家如何测试刚刚写的gulp-prefix插件。很多gulp插件使用的测试工具是mocha，首先将package.json中scripts字段的test值修改为mocha，修改后package.json为：{
"name": "gulp-prefix",
"version": "1.0.0",
"description": "",
"main": "index.js",
"scripts": {
"test": "mocha"
"author": "",
"license": "ISC"
这样当我们执行npm test，就能运行mocha测试工具。现在在本地创建一个测试脚本test.js：var assert = require('assert');
var File = require('vinyl');
var prefix = require('./');
describe('gulp-prefix', function() {
it('prefix test', function(done) {
// 创建一个文件
var file = new File({
contents: new Buffer('file data')
// 创建一个 prefix流
var stream = prefix('prefix ');
// 将文件写入prefix流中
stream.write(file);
// 等文件重新出来a
stream.once('data', function(file) {
// 检查内容是否一致
assert.equal(file.contents.toString('utf8'), 'prefix file data');
安装测试需要的包npm install assert mocha through2 vinyl --save-dev
运行测试[root@localhost gulp-prefix]# npm test
& gulp-prefix@1.0.0 test /root/gulp-prefix
gulp-prefix
? prefix test
1 passing (18ms)
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用过Gulp 模块进来看看
我想用这个模块研究Fe 金属&&看到里面有许多 Forcefield 该选哪个好？&&各位大牛 方面的话&&给看看&&选哪个& &先谢谢了 ！
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&materials studio中的GULP模块ReaxFF力场求助
materials studio中的GULP模块ReaxFF力场求助
作者 三价铁离子
如题，本人想用ReaxFF力场模拟分子反应，MS软件GULP模块中有这个力场（reaxff5.0和reaxff6.0），但这两个力场不能完全描述我的体系，想问有什么解决办法？
目前我自己知道的是自己编辑力场，不过这个太难了，我不具备这方面基础知识，请问还有木有其他方法，或者有哪些渠道可以下载ReaxFF的其他力场，然后导入到MS中来计算？谢谢各位！
祝福楼主了，
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