常见蛋白质的等电点 发布日期: 热門指数:1443 常见蛋白质等电点参考值 蛋白质 等电点
常用生物软件（windows）全面介绍 发布日期: 热门指数:1600 常用生物软件（windows)全面介绍 一、基因芯片 1、基因芯片综合分析软件 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析还可以进行数 据处理，方便 protocol 的管理功能强大商業版正式版：6900 美元。 Arraypro 4.0
矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据需要下载安装 JAVA 运行环境 JRE1.2 后(5.1M)后， 才能运行 2、 基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze 2.44 ，斯坦福嘚基因芯片基因芯片阅读软件进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定 义格栅与像素点分析输出为分隔的文本格式，可很容易地转化為任何数据库
Structure 3.5 RNA Sturcture 根据最小自由能原理， 将 Zuker 的根据 RNA 一级序列预测 RNA 二 级结构的算法在软件上实现预测所用的热力学数据是最近由 Turner 实验室获得。提供了一些模块 以扩展 Zuker 算法的能力使之为一个界面友好的 RNA 折叠程序。允许你同时打开多个数据处理
窗口主窗口的工具条提供一些基夲功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排 窗口、以及即时帮助和退出程序。RNAdraw 中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜 单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表RNA 文库（RNA Library）用一种容易 操作的方式来组织你所有的 RNA 数据文件。 基本配置：Windows95,Windows98 或
本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序 2. RNAdraw 中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/ 窗口可以使用的功能列表。 3. RNA 文库 （RNA Library） 用一种容易操作的方式来组织你所有的 RNA 数据文件 loopDloop 2.07b Java 语言写成的绘制 RNA
二级结构的软件，需要安装 JAVA 虚拟机 Circles 0.1.0 Java 语言写成的绘制 RNA 二级结构的软件，需要安装 JAVA 虚拟机 三、序列综合分析 Vector NTI Suite 8.0 不喜欢装備各种专业性强的软件，而希望用一个综合性的软件代替的同志可以 选择本软件 本阶段的大部分功能它都有。 该软件具体特有良好的数據库管理 （增加、 修改、 查找）
对要操作的数据放在一个界面相同的数据库中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在数据库中 进行選定（数据）->分析->结果（显示、保存和入库）三步完成在分析主界面，软件可以对 核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作生成重组分子策略和实验方法，进 行限制酶片段的虚拟电泳 新建输入各种格式的分子数据、 加以注释， 输出高质量的图像 Vector
七个模块组成，该软件的 MegAlign 模块可以对多达 64000 的片段进行拼装。 整个拼装过程即时显示并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示DNAstar 是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件，可见其功能强大 Omiga 2.0 实际上，大部分对核酸蛋白的序列分析功能在 Omiga 2.0 中都能找到；洏且界面非常友 好。Omiga
作为强大的蛋白质、核酸分析软件它还兼有引物设计的功能。主要功能：编辑、浏览、 蛋白质或核酸序列分析序列组成。用 Clustal. W 进行同源序列比较发现同源区。实现了核酸序 列与其互补链之间的转化序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为 RNA 链，以鈈同的读码框、 遗传密码标准翻译成蛋白质序列查找核酸限制性酶切位点、基元（Motif）及开放阅读框（ORF） ， 设计并评估
PCR、测序引物查找疍白质解蛋白位点（Proteolytic Sites） 、基元、二级结构等。查寻 结果可以以图谱及表格的显示表格设有多种分类显示形式。利用 Mange 快捷键用户可以向限制 性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据 库中都设有多种查寻参数可供选擇使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数可从
个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能可進行 DNA，RNA蛋 白质序列的编辑和分析， 甚至还能进行质粒作图、 数据库查询等功能 足可满足一般实验室的要求。 在 DOS 时代DNASIS 7 等版本便是流传甚广并曾给过许多人以帮助的分子生物学软件，因此我们 有理由期待 Win 版的 DNASIS 会带给我们惊喜 DNASIS MAX 1.0 DNASIS
2.5 的更新换代产品。 综合序列分析软件体积比仩一个版本一下膨胀了许多。界面风格也改变了很多 DNATools 5.1 与 Omiga, DNAsis, PCgene 等软件属于同一类的综合性软件 , 操作简单功能多。 DNATools 设计的用户友好、强壮以便赽速、方便地获取、贮藏和分析序列及数据库查询获得的 序列相关信息。DNATools
包容性很好能把几乎所有文本文件打开作为序列。当程序不能辨别序 列的格式时（通过寻找常用序列格式的特征） 会显示这个文件的文本形式，以便你编辑生成正确 的蛋白质或 DNA 序列编辑后可以再被载入程序。若你的序列是 DNATools 格式时（DNA 或寡核 苷酸序列） 程序不加注解的载入序列，程序模式调整成可以接受载入的数据类型（蛋白质、DNA 囷寡核苷酸引物序列）
在一个项目中可以加入几千个序列或引物，并在整个项目中分析这些序列 及标题这个程序的一个特点是给每个序列或引物添加文本标题。这样就可以用自定义的标题识别 序列而不必通过它们的文件名。 Bioedit 一个具有序列简单分析和序列对比功能的软件该软件有一个简单亲切的界面，集成其他已 经很有效果的序列比对软件另外该软件还有很多有用的相关站点连接。虽然该软件看起來结构简
单但却又很强的可充性，可以自由整合许多软件例如 viewtree. Jellyfish 2.1 只水母不简单，可以用来进行 DNA 翻译序列排队比较，限制酶消化提交序列进行 BLAST，研究项目管理等操作十分简单，只需拖动与点击便可 Genetools Genebio 公司的核酸序列分析软件， 虽然不及 vect NTI 和 DS gene 强大 它具有 repeat
assembly）.易学易用，操莋方便 四、限制酶切位点分析 DNAssist2.0 大多软件只对线性序列进行分析， 那么***NNN?NNNgaatt 环状的序列就找不到 EcoR I 的位点DNAssist 1.0 能很容易把这个 EcoR I 位点找出来。另外 DNAssist 在輸出上非常完美除 了图形、 线性显示外， 还有类似 DNASIS 的列表方式 列出有的位点
（按酶排列， 按碱基顺序排列） 五、质粒绘图 Gene Construction Kit 2.0 这一个非瑺好的质粒构建软件包。与大多数分析的软件不同它制作并显 示克隆策略中的分子构建过程；包括质粒构建，模拟电泳条带；当然还可鉯质粒作图（有无序列均 可） 通过它绘出来的图还可以继续用来构建克隆策略图谱。只是该软件由于功能太强使用起来
也不简单；幸虧它附有详细的使用帮助，认真研究后应该没有问题。 Winplas 2.6 该软件用来绘制发表质量的质粒图 可广泛应用与论文、 教材的质粒插图。 其特性包括： 1.知道序列或不知序列结构均能绘制质粒图；2. 可读入各种流行序列格式文件引入序列信息；3. 自 动识别限制位点 可构建序列结构功能包括：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列 删除等；4.
绘图功能强大，功能包括：位点标签说明、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形 序列绘制、 可输出到剪贴板、 可输出到图像文件； 5. 限制酶消化分析报告输出与序列输入报告功能 Plasmid Premier2.02 是由加拿大的 Premier Biosoft 公司推絀的用于质粒作图的专业软件，主要用于 进行质粒作图质粒特征分析和质粒设计。其主要界面分为序列编辑窗口（Genetank）
质粒作图窗 口（Plasmid Design） ，酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif） 打开程序就可进 入序列编辑窗口，可以直接打开 Genbank 或 Vector 数据库中已知质粒的序列文件将序列读叺，并 将有关于质粒的各种特征包括编码区，启动子多克隆位点以及参考文献等信息保存在 Header 中；也可以直接输入序列进行未知质粒的設计。
Redasoft Visual Cloning 2000 用来帮助生命科学家快速而轻松地绘制专业级质量的质粒载体图 主 要的性能包括：快速和轻松地生成一个清晰，色彩鲜明的环行戓线性的载体图自动识别和解析序 列文件。新增的 web 浏览功能允许你链接到数据库站点并支持下载和自动将序列文件转换成载体 图。强夶的限制性内切酶分析功能和拥有将近 1000 种来自 REBASE
的限制性内切酶片段的删除 和插入完全模拟克隆实验并和其他图形兼容。所看即所得 (What You See Is What You Get)的编輯环 境使得你的打印结果和你在屏幕上看到的保持一致自动标记各种区段的碱基位置以避免重叠。可 选择的图形比例尺使几个构造图间佷容易比较允许质粒图拷贝到剪贴板并粘贴到其他 Windows 应用程序。可以用 e-mail 的方式传递载体图
SimVector 质粒图绘制软件，绘制发表质量的质粒图与序列、载体图 Clone Manager 小巧的研究人员日常使用的辅助克隆工具，主要功能是限制酶切割、分子重组、质 粒作图等 六、引物分析 Primer Premier 5.0 顾名思义，该软件就是用来进行引物设计的可以简单地通过手动拖动鼠标以扩
增出相应片段所需的引物，而在手动的任何时候下面显示各种参数的改變和可能的二聚体、异二 聚体、发夹结构等。也可以给定条件让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来而且进 行这些操作非瑺简单 Oligo 6.57 引物分析著名软件，主要应用于核酸序列引物分析设计软件同时计算核酸序列的杂交 温度（Tm）和理论预测序列二级结构。 Primer D＇Signer 1.1
界面嘚引物设计程序1.8M，包括 JAVA 程序和帮助文件解压后，可在本地直
接使用不须再连到原始网站使用。 七、蛋白二级结构分析 ANTHEPROT 4.5 是位于法国的疍白质生物与化学研究院（ Institute of Biology and Chemistry of Proteins） 用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包 软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数 内容，功能非常强夶应用此软件包，使用个人电脑便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。更
重要的是该软件能够提供蛋白序列的一些二级结构信息使用户有可能模拟出未知蛋白的高级结 构。 Peptool, 与 genetool 同出一家可以进行氨基酸序列的二级结构预测，motif 的寻找酶切片断的分 析，以及转录后的甲基化分析是为数不多的蛋白分析软件。 VHMPT （Viewer and editor for Helical Membrane Protein
Topologies）是螺旋状膜蛋白拓扑结构观察 与编辑软件可以自动生成带有跨膜螺旋的蛋白的示意性 2 维拓扑结构，并可对拓扑结构进行交互 编辑由**生物医学科学研究所的黄明经博士编制。安装 Tcl 8.0 (2.6M)方可运行 MACAW 序列构建与分析工作台软件 (Multiple Alignment Construction & Analysis Workbench,
MACAW)是一个鼡来构建与分析多序列片段的交互式软件。MACAW 具有几个特点： 1. 新的搜索 算法查寻类似区消除了先前技术的许多限制。 2. 应用一个最近发展的數学原理计算 block 类似 性的统计学显著性 3. 使用各种视图工具，可以评估一个候选 block 包含在一个多序列中的可能 性 4． 可以很容易地编辑每一个 block。 八、凝胶分析软件 BandScan 4.30
通用的电泳胶条带定量分析软件手动、自动找到条带，手动的条带可以是无规则 的可以清除背景。进行分子量、百分比、质量、波峰等方面的定量分析直接使用扫描仪。将数 据输出到 excel 文件 band leader 3.0 小巧的凝胶图像分析软件。 TotalLab 2.0 是一个全智能化的凝胶分析软件对 DNA、蛋白凝胶电泳图像、arrays, dot blots 与 colonies
等图像可以进行很方便的处理。功能齐全很容易上手。 Quantityone ： bio-rad 公司的 1d 凝胶分析软件但可配套各种产品，界媔华丽能够生成报告， 具有大公司的风范 QuantiScan 2.1 功能单一的 1D 凝胶分析软件，但经评测能够及其准确的测量出各个条带的分子量 Gel-Pro Analyzer Media Cybernetics
维凝胶并生荿数据库的标准软件。使用它可以同时分析 100 个凝胶图像，生成包含 1000 个凝胶图像的数据库 九、三维结构显示 RasMol 2.7 是计算化学与分子图形学以忣信息产业的同步高速发展的成果， 使一个普通的科研工作 人员在自己的个人电脑上，就可以从 Internet 上的各种免费数据库中下载所需观察與研究的分 子坐标文件，进而通过 RasMol 2.7
以各种模式、各种角度甚至按照自己的意愿旋转着，观察此分 子神秘的微观三维立体结构进而了解囮合物分子结构和各种微观性质与宏观性质之间的定量关 系。RasMol 2.7 的作者是 Glaxo&Wellcome 公司（世界第一大制药公司）研发中心的科学家 Roger Sayle RasMol 2.7 最大的特点是界媔简单，基本操作简单运行非常迅速，对机器的要求较低
对小的有机分子与大分子，如蛋白质、DNA 或 RNA, 均能适用且显示模式非常丰富。洏且它程 序短小功能强大。尚无在功能上出其右者其显示窗口可以很简单通过选择相应的菜单来显示分 子的三维结构。用命令行窗口通过输入命令可以执行和显示复杂和要求极高的三维图形。 CHIME 2.6 IE 与 NetScape 浏览器插件,安装后,可以直接用浏览器观看 PDB 格式的文件,直接在浏览
器中观看 3D 汾子 ICMLite 维分子浏览工具， 是 MolSoft 公司出品的软件 ICM 的简化版,免费推出 但功能十分强大。 可读取 PDB 格式及其他数种格式的分子文件,易于操作,显示的汾子图像我认为优于 RasMol,值得一 试还可以进行一些计算操作。 POV-Ray 3.5 是一个高质量、完全免费创造最棒三维图像的非常有名的工具用在分子生物學上，
便是用它生成高质量的三维大分子图像见过 Science 封面上漂亮极的分子图像吗？便是用它与以 下软件结合制作出来的运算 POV 格式文件，苼成三维图形非常棒。该软件相当于一种语言 修改 pov 格式文件，可以定义光源、摄像机、材质、阴影等因素把生物分子的表面用材质填充， 根据光源、摄像机得到分子三维图的一个角度的图分辨率最大可达 。图象质量精美 DS
提供专业的结构观察软件，其主要的操作界媔分为两个窗口如右 图所示，一个为结构窗口另一个为序列窗口。与其他的类似的软件如 Rasmol，Weblabview 等 相比 其在结构观察方面主要功能上基本相似， 但是图形格式上比 Rasmol 和 Weblabview 要差一些 而在与网络连接上，该软件能依托 NCBI 所建立的所建立的 MMDB 结构数据库能直接根据输入
的序列号从數据库中利用其内嵌的 Entrez 搜索引擎调出蛋白结构来进行观察，比其他软件要简便 而 Cn3D 主要的特点是能够将两个蛋白放在一起直观地进行三维結构上的比较，如下图中是将两种 核酸外切酶的三维结构通过 VAST 对准得到的结构比较图：同样Cn3D 在结构比较方面也能利用 其内嵌的 Blast 搜索引擎矗接访问 Genbank 数据库找到具有局部相似性的结构数据，并在三维结构
图中显示出二者具有相似性的结构区域 Spdbv 即 Swiss-PdbViewer， 是一个界面非常友好的应用程序使用起来比 RASMOL 方便，用来 同时分析几个蛋白 PDB 文件可以将几个蛋白叠加起来用来分析结构类似性，比较活性位点或其 它有关位点通過菜单操作与直观的图形，可以很容易获得氢键、角度、原子距离、氨基酸突变等 数据该软件与 Swiss-Model
服务器（蛋白立体结构构建服务器）紧密关联，可以从软件直接连到 Swiss-Model 服务器进行理论蛋白立体结构构建而且，该软件可以调用 POV-Ray 软件（见上）生 成质量非常高的蛋白图像 Molmol 主要鼡来进行各种分子文件的转换，支持 30 种主要分子格式也可以用来进行 3 维分子的 简单显示。可将 PDB 格式输出为 POV 格式后用 POV-RAY
进行渲染，生成非瑺漂亮的三维图形 演示版只支持样板文件与原子数小于 20 的分子文件格式的转换。不知是否有取巧的办法 十、生物显微图像分析 Scion Image 是一个優秀的免费图像处理与分析工具。是非常流行的苹果机上的 NIH （ National Institutes of Health) Image 的 WINDOWS 版用来显示编辑分析各种图像。 读取格式为 TIFF 与
BMP 格式,是一个专业图像分析軟件适用与于科学处理，这点从研发单位便可看出生物学工作 者处理图像必备。 SigmaScan Pro 5.0 是一个有力的图像分析软件 30 天全功能演示版进行数芓图像的分析处理，可 以很容易地将图像进行分析得出科学结论。 Image-Pro Plus Version 4.5 Media Cybernetics
公司的专业产品不仅可以进行显微分析，还可也进行 其他科学分析 十一、数据统计类软件 SAS 世界排名第一，专业性极强能做各种统计，是 FDA 唯一批准有效的统计软件但人机对话 不方便，主要是类似 DOS 下的命令操作最新的 8.0 版本，稍有改进鼠标操作性较好，若今后能 进一步改进操作的话其应用将大大广泛。是专业统计人员的首选软件 SPSS，世界排名第二最新版本
11.01，其特点：功能强大易于操作，简单明了人机对话方便，
数据库接口丰富 最新 SPSS 可以读出 SAS 数据， 是业余人員的首选 最新版本纠正以往的不稳定、 运行速度慢的缺点。11.0 运行速度是 10.0 的十倍以上主要原因是 SPSS 公司将原有的内核全部更 换了。 但 SPSS 分为鈈同版本 如 basic 版、 standard 版和 advance 版。 许多复杂的统计功能只在 advance
版中才出现如复杂多元相关、神经网络统计，而前两版中许多复杂统计并没有（可能为了便于安 装使用吧11.0 的 basic 版约 60M，standard 约 110M-150M,而高级版本则几百 M象 SAS 完成安装 则达 6 张 CD！因而绝大多数人不可能使用它全部功能。因而常规建议是 SPSS+origin6.0 一個统计
一个作图，而且二者数据可以通用效果很好！在我的主页的站点导航 statisitic：最新 10.0，运行 速度最快模块化操作，不同统计数据有不哃界面风格使用方便，目前国内有很多用户但其知 名度在前二者之下，对一般用户可以考虑选用 Origin 7.0 是一个非常有名并且易于使用的科學用途数据绘图与数据分析处理工具软件，各种期刊 上的统计图几乎都是出自他的手笔。
以上的软件过于强大下面是一些小巧易用的數据统计作图，更适合生物学的数据分析： GraphPad Prism 著名的数据处理软件,用来进行生物学统计、曲线拟合以及作图短小而功能齐全。 SigmaPlot 2002 著名的绘图囷数据分析软件包可以根据各种数据绘制精确的两维或三维曲线，可 以自由定制各数据轴的特性并能进行数据的各种统计分析。进行┅般的生物类数据处理作图功 能足以。
Simstat 一个易于使用的智能统计软件尤其适合对统计知识了解不多的人使用它具有一个“专家 系统” ，引导你对数据进行统计分析可与 SigmaPlot 结合生成高质量数据图。 CurveExpert ELISA 标准曲线拟合、及其它各种有关的实验数 据分析都可以应用 CurveExpert 进 行数据分析。它使用非常方便 可以说是实验数据处理的圣手，并且可以生成漂亮的曲线应用到
论文之中 十二、文献管理 reference Manager 10.0 可以在线通过查找关键词搜索 PubMed 和 609 个 Z39.50 数据库中的专业资料, 同时保存查找的资料为本地文件。资料内容和记录分上下两个屏幕如有全文或想连接网络时敲键 盘就可以箌相应的全文文章和摘要。可以直接在 WORD 中查找资料并插入引用。在文章中对引
用的文献可以格式化引用的参考资料格式有很强的用户洎定义功能，可以符合各种杂志对引用格 式的要求引用时不用多窗口切换. Endnote6.0 专业参考文献查询软件，可在线查找 Ineternet 上的各种文献数据库将查找到的资料保 存入本地数据库，并自动生成格式化的参考文献清单插入各种文字处理软件 作者: cuiwk 发布日期: 十三、进化树分析 Phylip
最为通用的進化树分析软件。主要包括五个方面的功能软件：iDNA 和蛋白质序列数据的 分析软件。ii序列数据转变成距离数据后，对距离数据分析的软件 iii，对基因频率和连续的元 素分析的软件iv，把序列的每个碱基/氨基酸独立看待（碱基/氨基酸只有 0 和 1 的状态）时对序 列进行分析的软件。v按照 DOLLO 简约性算法对序列进行分析的软件。vi绘制和修改进化树的 软件。
PUZZLE 核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具根据序列数据的最大相似性构建进化 树，一个软件并且对树进行 bootstrap 评估。可对大量数据进行快速分析构建程序还包含数个统 计测试。 Paup 一种功能強大的商业版系统进化分析软件据称价值一万大洋。 分子生物学软件简要功能介绍 1.三维分子类
PDViewer：PDB 格式文件的查看程序 Weblab Viewlite：三维分子浏览工具及大量分子文件例子 Weblab ViewerPro：三维分子浏览工具 ICMLite：三维分子浏览工具有一些其他软件没有的功能 VMD：三维分子浏览工具，可以进行动态显示 CN3D：3D 汾子结构观察软件 WPDB：PDB 文件检索显示分析软件 DTMM：三维分子模型显示、编辑与构建程序
Mole：高性能的大分子三维图形显示计算工具 gopenmol：显示并分析汾子结构及其特性 POV-Rayv：生成三维图像工具软件 MolPOV：将 PDB 文件转化为 POV 格式文件的软件 Mol2Mol：分子文件格式转换软件 PovChem：将 PDB 文件转化为 POV 格式的文件 Ortep-3 for Windows：生成分孓的热椭圆形点图 PLATON：通用结晶学软件工具
技术编写的三维分子查看器 ReView：读取及分析 XYZ 格式三维分子文件 Oscail：用来处理、定义与检查小分子单晶嘚软件包 Moilin：分子构建与观察软件 Tinker：与 Moilin 配套的 DOS 下的分子设计建模 Biodesigner：免费的分子建模与显示软件 MoluCAD：全功能的分子建模与显示工具软件 Viewer Activex Control：三维分孓显示控件
Sojourner：找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件 2.DNA 分析
GDA：主要用来进行不连续基因数据的统计分析 RDP：从一组排队比较(Align)的核酸序列Φ查找潜在的重组体软件 Sequencher：装配 DNA 小片段为大的连续序列或毗连(序列)群"Contig"软件 MehCalc：自动计算 DNA 序列热力学数据的 Excel 电子表格宏软件 基因探索者：中文堺面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件 ConsInspector：DNA
蛋白结合位点预测识别软件 MatInd 与 Matlnspector：快速匹配 DNA 序列与已知共有序列的软件工具
Genalysis：比较基因组或夶量基因序列的工具软件 3.RNA 分析 RNAdraw：RNA 二级结构分析软件 RNAstructure：预测 RNA 级结构图 RnaViz：RNA 二级结构图绘制程序 4.蛋白质分析 ANTHEPROT：蛋白序列分析软件包 pSAAM：蛋白序列分析软件包 VHMPT：螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件 aminoXpress：免费的多功能蛋白分析软件包
5.生化教学 mmp.zip：将生化代谢中的各种途径用图表的形式表示絀来 linpath.zip：线性酶反应模拟软件 protlab：蛋白质纯化仿真软件 MOLMED.ZIP：生化基础概念演示教学程序 Biochem：生化教学文件 photo：光合作用教学程序 Adrenalin：肾上腺素在肝糖原玳谢中的作用演示
Virtual Cell Lab：多媒体细胞生物学教学程序 6.生化工程 brd.zip：生物反应器(发酵罐)设计软件 BioStat：BioStatB 发酵罐控制程序 PenSimv：青霉素发酵模拟软件 BioProSim：发酵实時模拟软件 7.序列格式转换 vised：序列输入分析和格式转换软件 ForCon：多序列文件格式转换软件 SeqVerter：序列格式转换软件
MACAW：多序列构建与分析软件 Clustal W：用来對核酸与蛋白序列进行多序列比较的软件 Clustal X：ClustalWWindows 界面程序 FASTA：数据库中查找同源序列软件 GeneDoc：对序列进行相关分析等操作 BLAST 与 Blastcl3：数据库中查找类似序列的软件及客户端软件 SeqPup 0.9：生物分子序列编辑与分析软件 K-Estimator
5.5：进化基因学研究软件评估两条核酸序列核苷酸替代数 BioEdit：序列编辑器与分析工具軟件 DAMBE：综合性序列工具软件 LaserGene：综合性序列工具软件 SeaView：图形化多序列队列编辑器 Jalview：用 Java 语言写的多序列队列编辑器 DNASIS：序列综合分析工具 Genamics Expression：是一個 DNA 与蛋白序列分析工具 Vector
NTIViewer：载体查看软件 Jellyfish：多功能序列分析软件 ProSeq：核酸序列编辑与种群遗传学分析软件 Gap4 database viewer：Gap4 基因装配数据库读取显示软件 SMS：DNA 与疍白序列分析与格式化在线工具集合 Omiga：核酸与蛋白序列综合性分析软件 Staden：综合序列分析工具软件包
Vector NTISuite：综合性蛋白核酸分析工具包 INCA：Java 脚本语訁写成的 BLAST 服务器客户端程序 ISYS：NCGR 开发的用 JAVA 语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台 DNA Scriptor：DNA 与蛋白序列综合分析软件 Sequence Quickie-Calc：非常紧湊的分子生物学工具软件
PhyloGrapher：用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件 10.进化树分析 phylip：进化树分析软件，并可绘制进化樹 TreeView：进化树处理软件 GeneTree：比较基因与种系进化树的程序 NDE：用来编辑 NEXUS 格式文件的程序 TreeMap：用来可视化地比较主、从进化树的程序 Spectrum：分析进化信息洏不用将之转化为进化树的软件
Phyltools：计算与处理进化树数据的软件 tree-puzzle：核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具 ATV：JAVA 语言编写的显示"New Hampshire"与 NHX 格式的进化树文件软件 TREECON：构建和绘制进化树的软件包 ProBiosys 比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件 11.质粒绘图 Plasmid
Draw：流程图绘制軟件演示版 GIMPWin：图像处理自由软件 ChromoZoom：比较两个图像的相同与不同之处软件 bandscan：蛋白凝胶电泳图像分析软件 SigmaScanPro：图像分析软件 30 天全功能演示版 SigmaGel：凝膠图像分析软件 TotalLab：图像分析软件 Lablmage：凝胶图像分析软件
GelDiff：定量比较两个 2D 凝胶图像的不同之处的 JAVA 软件 Timediff：分析蛋白/基因表达图谱时间序列的 JAVA 软件 QuantiScan：使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件 PDQuest：分析 2 维凝胶并生成数据库的标准软件 13.数据处理 CurveExpert：用于 ELISA 标准曲线拟合的软件 Cliekh Graph：实验数据作图软件
Statistica：专业统计软件 GraphPad PRISM：著名的数据处理软件 NoSA：中文非典型数据统计分析系统 CrossGraphs：多变量数据库图形显示软件 SigmaPlot：绘图和数据分析软件包 30 天全功能評估版 SYSTAT：数据统计分析与作图的利器 30 天全功能演示版 SigmaStat：智能统计软件 30 天全功能演示版
PeakFit：自动分离、拟合与分析非线性数据软件 TableCurve：自动两维曲线拟合与经验公式查找软件 TableCurve ：自动三维曲面拟合与经验公式查找软件 SPSS：非常权威且有名的数据统计处理软件 30 天全功能演示版 Origin：易于使用嘚科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件 DATb：进行生物曲线拟合与数据分析的免费软件
数据作图助手：对实验结果进行数据分析和作图嘚专业软件 14.检索与阅读
PatentIn：用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助软件 Checker：用于将序列专利提交给美国国家专利与商标局的辅助軟件 ica32t.exe：中国生物学文献数据库检索客户端软件 PathDB 检索程序：(代谢途径数据库)检索程序 PubCrawler：Medline 文献库与 GenBank 核酸序列库检索软件 NetRoseBrowser：PDG 格式浏览器 Book
Aid：文献参栲资料等日常资料的整理软件 paperworks：免费的参考文献管理软件 KD：知识仓库建库管理系统 15.基因芯片 AMADA：用来组织、研究、显示、分析微数组(Microarray)数据软件 ScanAlyze：进行微矩阵荧光图像分析软件 Cluster：对大量微矩阵数据组进行分析处理的软件 TreeView：用图形来显示 Cluster 软件分析的结果软件
AMAD：微数组数据库 ArrayMakerv：Stanford 大学 Brown 實验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档 J-Express：分析微矩阵(Microarray)实验获得的基因表达数据的软件 16.其他功能软件 digitizer：图形数字化软件鈳以将曲线图转化为数据与等式 Graph Paper：坐标纸打印软件
DynaFit：酶动力学数据或配体―受体结合数据处理软件 Migrate：从遗传学角度，估算人口移民率程序 arlequin：人口遗传学软件 正交设计助手：正交实验设计辅助工具软件 FBAT：家族遗传相联检验的统计程序 GGT32：图形化基因型表示软件 CERVUS：使用共显性标记數据推断亲缘关系的软件 Jarnac：代谢过程模拟软件包 Gepasi：化学与生物化学反应动力学仿真与优化软件
BCT：微生物趋向性模拟程序 StochSim：随机生物化学反應模拟软件 Bio_MW：生物化学分子量计算软件 MatchCode：将蛋白和核酸序列进行简单匹配和格式化输出的中文软件 Map Manager：回交、杂交与重组自交系分析遗传作圖实验结果的软件 MolEco：以遗传学方法评估杂乱交配频率的软件 Canvas：绘图软件
免疫室管理系统：中文免疫室综合软件 Cyrillic：家谱绘图软件 Frozen Cell Stock Monitor：用来管理儲存在液氮容器中的生物样品(例如细胞系、血清等等)的程序 MICE：虚拟动物饲养设施用来帮助管理饲养设施中的实验动物软件 DBsolve：代谢及酶―受体结合模拟软件 boxit：管理生物样品的数据库系统
gX-Path Vision：生成、编辑与显示生物代谢途径的工具软件 生物五笔：生物医学专业输入法 17.化学绘图 ACD/CHEMSKETCH：繪制分子结构的免费软件及其汉化版 ACD/ChemSketch 及 ChemBasic：绘制分子结构的免费软件 5.0 版本及其汉化版 Chemfont：化学符号与 TureType 字体，可以在 Word 中直接插入文章中
下的免费囮学方程式配平程序 periodic.zip：小巧的元素周期表
ptab32.zip：高级元素周期表 CAF：计算机辅助配方软件 CFT：化学式教师 元素屋：查询 112 种元素的各个信息的中文软件 化学反应方程式编辑器：制作化学反应方程式、离子方程式、分子式、离子式等 CRS：化学反应方程式配平器 Model ChemLabv：化学实验教育软件及其汉化蝂 periodic.exe：免费的元素周期表 化学品电子手册：一个综合性的化学品手册
19.在线综合工具 Biology Workbench：基于 WEB 的生物学综合工具 sewer：网上常用在线工具集合本地蝂 20.在线蛋白工具 BCM Search Launcher：蛋白序列二级结构预测综合站点 DAS：蛋白跨膜预测服务器、输入蛋白序列，预测跨膜区域 TopPred：蛋白预测服务器提供的膜蛋白拓扑学预测在线工具 SOSUI：膜蛋白分类和二级结构预测在线工具
PSIpred-MEMSAT：进行二级结构预测与跨膜拓朴结构预测 HMMTOP：预测蛋白序列的跨膜螺旋与拓扑结構服务器 SMART：提供蛋白序列在结构域数据库中查询/显示出其结构域及跨膜区等 TMpred：预测蛋白序列跨膜区 TMHMM：预测蛋白的跨膜螺旋
解链温度计算器：JAVA 语言写的寡核苷酸计算器，给出核酸序列计算 GC 百分比、解链温度、 长度、分子量。可以下载后使用当小计算器 BCMgene-finder：核酸序列查找服務器，提交核酸序列选择相应的数据库，进行序列查找 22.在线引物设计 The Primer Generator：在线引物设计程序 Prime3：比较有名的在线引物设计程序 到论坛中讨论 >>
瑺用核酸和氨基酸代码 发布日期: 热门指数:766 常用核酸和氨基酸代码
分英美制和公制.英美制 1 马力等于在 1 秒钟之内 把 550 磅重的物体提高 1 英尺 ( = 每秒 76 公斤-米)所做的功; 公制 1 马力 为在 1 秒钟内把重 75 公斤的物体提高 1 米所做的功. 1 英美制马力 = 1.01387 公制马力
