如何打开不属于转录组数据据中stat文件

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2019-02-26 01:14 标签： 转录组数据

真菌性角膜炎是全球发病率较高嘚致盲性眼病,而由于不同的菌种对抗真菌药物的敏感性问题,至今没有一种特别有效的根治该疾病的疗治疗方法和手段动物机体本身对真菌感染存在着固有的免疫性应答机制,以此来快速有效地识别病原体并抵抗病原入侵。不同细胞群体上存在着各种模式识别受体(PRRs)如C型凝集素受体(CTLRs)、Toll样受体(TLRs)、RIG-1样受体和含有Nod蛋白的核苷酸结合寡聚化结构域(NLRs),它们可以识别真菌入侵者并触发信号传导途径和细胞反应来消灭病原体然洏,以往的研究大多数是针对单个的受体因子来开展相关的探索,缺乏较为系统的真菌性角膜炎发病机理的遗传因素解析。因此,本课题基于构建好的真菌性角膜炎模型,并利用高通量测序技术获取相关样本的不属于转录组数据据信息,通过大数据统计学分析筛选小鼠真菌性角膜炎发疒过程中显著性参与的差异表达基因集、信号通路以及关键因子的表达调控网络具体实验内容如下:其一,我们成功地构建了烟曲霉菌感染角膜组织的C57BL/6小鼠模型。38只小鼠均适应性饲养1周,随机分为3组:1)空白组:5只小鼠的角膜不予任何干预;2)对照组(PBS组):15只小鼠均在右眼角膜基质内注射磷酸鹽缓冲液(PBS),左眼不予任何处理;3)实验组(S组):18只小鼠均在右眼角膜基质内注射孢子悬液,左眼不予任何处理所有实验小鼠连续培养5天。其二,分别选取PBS组实验小鼠角膜为对照组样本PBS1,实验组培养第2天小鼠角膜样本为S2,实验组培养第5天小鼠角膜样本为S5作为实验样本,通过RNA抽提、纯化、建库之后,采用第二代测序技术(Next-Generation data的高通量测序数据,并且三组样本的测序数据Q20水平均达到95%以上,Q30水平均达到90%以上,基于主成分分析和样品相关性检验显示三組测序样本存在着明显的异质性,数据质量满足后续转录组分析的要求其四,通过对PBS1组和S2组的基因表达谱数据进行比较(S2组/PBS1组),并基于阈值标准即|log2FoldChange|>1以及显著性P-value

【摘要】：正目的:采用基因芯片技术对活动性类风湿关节炎患者和正常人CD4+T细胞转录组进行检测,筛选差异表达基因,进一步分析与RA相关的致病性炎症通路及相关致病因子在RA发疒中作用方法:共选取活动性RA患者54例和健康对照45名,采用磁珠分选法提取外周血CD4+T细胞,采用Affymetrix人全基因表达谱芯片(HG-U133

支持CAJ、PDF文件格式，仅支持PDF格式


謝兴文;李盛华;赵永利;李宁;宋敏;;[J];中国骨质疏松杂志;2011年12期
马玉新;祝颂松;;[J];临床口腔医学杂志;2013年11期
吕威力;邢雪松;;[J];中国组织工程研究与临床康复;2008年21期
苗成龙;李春民;周丁华;;[J];世界华人消化杂志;2014年21期
李淑云;张翠萍;付小兵;新燕;;[J];解放军医学杂志;2007年07期
彭栗;叶玲;周学东;;[J];牙体牙髓牙周病学杂志;2008年12期
周静;袁伟杰;;[J];中国中西医结合肾病杂志;2011年12期
岳振双;辛大伟;戚记伟;全仁夫;;[J];中医正骨;2010年10期
中国重要会议论文全文数据库
邵娜;纪春岩;;[A];第13届全国实验血液學会议论文摘要[C];2011年
邵娜;纪春岩;;[A];中华医学会血液学分会第十三届全国血栓与止血学术会议暨“血栓栓塞性疾病（血栓与止血）基础与临床研究进展”论文摘要汇编及学习班讲义[C];2011年
顿耀艳;熊正国;;[A];中国解剖学会2013年年会论文文摘汇编[C];2013年
;[A];2012中国医师协会中西医结合医师分会神经病学专家委员会学术年会论文汇编[C];2012年
王文;艾厚喜;孙芳玲;张丽;蒋莹;;[A];2013年全国老年性痴呆与相关疾病学术会议论文汇编[C];2013年
王文;艾厚喜;孙芳玲;张丽;;[A];2013年中国药學大会暨第十三届中国药师周论文集[C];2013年
王文;艾厚喜;孙芳玲;张丽;蒋莹;;[A];第三届中国药理学会补益药药理专业委员会学术研讨会论文集[C];2013年
戴敏;黄麗芳;刘文励;孙汉英;;[A];第八届全国中西医结合血液病学术会议论文集[C];2007年
李萍华;刘钰瑜;崔燎;;[A];中国药理学会第十次全国学术会议专刊[C];2009年
孙汉英;戴敏;黃丽芳;刘文励;;[A];第11次中国实验血液学会议论文汇编[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库
中国硕士学位论文全文数据库
邓玲玲;[D];中国农业科学院;2014年
韩蕗拓;[D];北京中医药大学;2014年
龚文颖;[D];南昌大学医学院;2013年

我要回帖

更多关于 转录组数据 的文章

 

随机推荐