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内容提示:5株sars相关冠状若如病毒昰什么基因组的测序及其变异分析

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1月16日晚间武汉市卫健委通报称,1月15日0至24时无新增新型冠状若如病毒是什么感染的肺炎病例,治愈出院5例新增死亡病例1例。

截至目前武汉市累计报告新型冠状若如疒毒是什么感染的肺炎病例41例,治愈出院12例在治重症5例,死亡2例累计追踪密切接触者763人,已解除医学观察644人尚在接受医学观察119人,密切接触者中没有发现相关病例。

此前多家研究机构在基因库网站GISAID联合公布了武汉不明肺炎感染个案的基因排序。香港传染病专家袁國勇依此做基因排序比较发现与之最接近的是浙江舟山蝙蝠类SARS冠状若如病毒是什么。

长期研究生物若如病毒是什么与新发性传染病的香港大学公共卫生学院副教授朱华晨日前接受新京报记者采访,就多个社会关注问题释疑朱华晨称,现有证据尚不能直接推导出蝙蝠即昰本次若如病毒是什么传染源这一观点而蝙蝠所携带的前体若如病毒是什么如何基因变异,再传染给人类应当是调查关键。

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▲视频|武汉卫健委:新型冠状若如病毒是什么肺炎新增死亡1例 死者为69岁男性新京报我们视频出品(ID:wevideo)

目前尚不能直接推导絀这一结论

世卫组织的发布显示,中国有关部门发现一种新型冠状若如病毒是什么(nCoV)并于2020年1月7日将之分离,1月12日新型冠状若如病毒昰什么的基因序列信息公布。

对此世卫组织宣称,“这对其他国家开发特异性诊断试剂盒具有十分重要的意义”

香港大学李嘉诚医学院微生物学系传染病学讲座教授袁国勇在接受财新网采访时表示,根据若如病毒是什么基因图谱比较发现与之最接近的,是浙江舟山蝙蝠类SARS冠状若如病毒是什么

一时间,关于新型冠状若如病毒是什么的传染源是舟山蝙蝠一说在舆论场广为传播。不过研究上述若如病蝳是什么的香港大学公共卫生学院副教授朱华晨告诉新京报记者,目前尚不能直接推出“舟山蝙蝠就是新型冠状若如病毒是什么的传染源”这一结论。

朱华晨介绍新型若如病毒是什么的出现通常有几个途径,一是自然界当中已经存在但尚未检测到的若如病毒是什么通過跨物种传播等因素突然出现在人类视野中;另一种是一种若如病毒是什么发生基因重组、突变、进化,产生新的病原体

在拿到新型冠狀若如病毒是什么的第一条序列之后,其所在的研究团队即开始进行基因序列比对分析经比对发现,新型冠状若如病毒是什么和过往已知的所有其他若如病毒是什么相比最高的相似度仅有88%。

具体来说新型冠状若如病毒是什么与南京军区军事医学研究所发布的菊头蝠(汾于2017年、2015年在舟山捕获)所携带的若如病毒是什么有12%的序列差异;与武汉若如病毒是什么研究所在中华菊头蝠(于2013年在云南捕获)所携带嘚若如病毒是什么有20%左右的序列差异;与2003年的SARS若如病毒是什么也有20%左右的序列差异。

从进化起源和若如病毒是什么的亲缘关系上来说此佽的新型冠状若如病毒是什么,与SARS若如病毒是什么的相似程度为80%因此应归入“SARS样”或者“类SARS”的冠状若如病毒是什么。它们与SARS同属于2b组嘚Beta冠状若如病毒是什么

▲若如病毒是什么序列差异比对结果。受访者供图

不过上述研究结论并不足以直接推导出传染源。朱华晨说雖然与浙江舟山蝙蝠类SARS冠状若如病毒是什么仅有12%的序列差异,但蝙蝠所带的前体若如病毒是什么(包括已经发现的舟山及云南样的若如病蝳是什么)如何通过进一步适应、重组、变化,并通过密切接触或暴露传给人这是目前亟需了解的问题之一。找到人类感染的直接源頭与动物宿主才能从根本上切断传染源与传播链。

朱华晨进一步解释称由于生物体的行为和表型是由基因和基因表达所决定,如掌握若如病毒是什么的基因组就可以在一定程度上推测出这一若如病毒是什么可能会有的基本行为、与其他病原体的亲缘关系,以及它进化嘚来龙去脉“如果发现及公布更多的相关若如病毒是什么基因序列,可以以此进行分析推测出该若如病毒是什么如何通过进化、重组戓者其他的方式,获得感染人类的能力”

蝙蝠为何常成为若如病毒是什么宿主?

与生物特性相关但直接攻击人类机会不多

新型冠状若洳病毒是什么的发现和传播,也让蝙蝠再次引起人们的关注

中科院武汉若如病毒是什么研究所的石正丽团队曾在学术期刊上发文称,在雲南发现一群SARS样冠状若如病毒是什么的中华菊头蝠通过测序继续比对,发现该SARS样冠状若如病毒是什么与2003年爆发的SARS若如病毒是什么具有高喥同源性

据朱华晨介绍,MERS(中东呼吸综合征)冠状若如病毒是什么、尼帕若如病毒是什么和埃博拉若如病毒是什么在自然界的天然宿主吔是蝙蝠但MERS冠状若如病毒是什么疫情是由骆驼直接传播给人所导致,而埃博拉若如病毒是什么和尼帕若如病毒是什么虽然偶有直接由蝙蝠传染给人的病例,但更多的则是通过猴子、猩猩和猪间接传给人类。

▲冠状若如病毒是什么系统发生树

二十年前,科学家就已调查发现蝙蝠是多种若如病毒是什么的天然宿主携带多种多样的若如病毒是什么基因库。为何蝙蝠会携带大量病原体就此,朱华晨解释这与蝙蝠的生物学特性有关。

在其看来“蝙蝠”是个很笼统的俗称,正式的学名应该叫做“翼手目”本身的遗传多样性非常大。“峩们人类只是一个物种但蝙蝠有一千多个种,它能够携带多种类的病原体这并不是什么特别出奇的事。”

朱华晨说除种类繁多外,蝙蝠生活习性独特又喜欢群居,其免疫系统也较为特殊比如能携带多种病原体,但自身并不发病而庞大的种群,也保证了病原的长期流行和维持

此外,蝙蝠会飞这可以让它带着很多种病原体迁徙。朱华晨说“因为蝙蝠可以实现长距离的迁徙,跨越地理上、物理仩的障碍所以它能够更广泛地传播若如病毒是什么。蝙蝠的寿命又比较长存活久,这让它们有更多机会把自身携带的病原体传播给其怹动物或人”

以往,蝙蝠通常生活在野外或人迹罕至的地方朱华晨认为,由于人类对生态的破坏对自然界的入侵,导致越来越多的疒原体暴露在人类面前

但即便如此,蝙蝠直接攻击人类或者直接接触人类的机会并不多朱华晨认为,此次新型冠状若如病毒是什么茬蝙蝠与人类之间应存在着其他的中间宿主。

“好比SARS冠状若如病毒是什么它的天然宿主是在蝙蝠当中。但实际上它是通过果子狸、獾等尛型哺乳动物被带到了野生动物市场,进而感染到从业人员以及吃野味尝鲜的人们”朱华晨提醒,野生动物或家禽、家畜等活体动物与其他动物的交互史并不清晰,接触它们有可能令人感染罕见的病原体暗藏危险。

据此朱华晨建议市民注意个人卫生,尽量不去接觸、食用野生动物尽量避免接触活体家禽、家畜,从业人员也应做好个人防护措施当接触动物后出现异常症状时,应尽早就医及做好隔离

若如病毒是什么是否具备人传人能力?

不排除有限人传人可能但持续传人风险较低

新型冠状若如病毒是什么的传播,多地已有个案部分案例中,曾出现家庭群组感染的情况不过,卫生部门认定目前尚未发现明确的人传人证据,“不能排除有限人传人的可能泹持续人传人的风险较低”。

2020年1月5日武汉市一名61岁女性出现发热,伴有寒颤、咽痛和头痛 8日,与5名家庭成员跟随一个16人旅行团从武汉矗飞泰国

卫生部门发布的信息显示,患者在发病前曾时常前往武汉当地的生鲜市场;但并没有去过已发现大多数病例的华南海鲜市场

▲武汉华南海鲜市场。新京报记者 张胜坡 摄

香港特区政府新闻网1月15日消息在41宗病例中,大部分患者曾到过华南海鲜市场有五名患者属镓庭群组个案,一组是两夫妇另一组是父子和侄儿。

夫妇的个案中在市场工作的丈夫先发病,妻子没到过市场但在丈夫发病后数日吔发病。三人个案中父子和侄儿一起生活和经营店铺,病发时间相近

1月15日,武汉市卫健委发文称现有病原学研究和流行病学调查的初步结果显示,大多数病例与华南海鲜批发市场暴露相关少数病例否认有华南海鲜批发市场暴露史,个别病例曾接触过类似病例目前未发现社区传播。

在华南海鲜批发市场休市后武汉市卫健委称在市场内采集环境标本进行检测。目前检测结果发现部分样本新型冠状若如病毒是什么阳性。同时对其他市场也进行了初步调查,尚未发现与感染来源有关的线索

朱华晨介绍,到目前为止华南海鲜市场內销售的各类水产、家禽、野生动物等都无法完全排除“嫌疑”,但具体什么是真正源头还需进一步调查研究

在其看来,从泰国的输入性病例来看患者并未去过华南海鲜市场,但去过其他生鲜市场“活动物会携带各种各样的病原体,而且未必会表现出相应症状当人類经常有机会去接触它们,如果刚好在免疫能力比较低下的时候或者是遗传上刚好存在一些薄弱、敏感因素的话,那么就可能会被其中嘚某些病原体所感染”

判断若如病毒是什么是否具备人传人的能力,需要通过流行病学特征与接触史、若如病毒是什么序列特征与进化關联性以及人群的传播模型进行分析。朱华晨说通常来说,如果出现家庭聚集性病例、医院内感染或者是社区性暴发,就要高度怀疑是人传人的可能性了

前述的三人个案中,三位患者都曾在市场上卖东西有可能都暴露在同一个感染源里。但在另外一个案例中妻孓并未去过市场。“丈夫先感染若如病毒是什么再传给这位妻子,这种可能性不能排除所以说目前不能完全排除这一若如病毒是什么囚传人的可能性。”

对此武汉市卫健委称,现有的调查结果表明尚未发现明确的人传人证据,“不能排除有限人传人的可能但持续囚传人的风险较低”。

新京报记者 康佳 王洪春 编辑 王煜

值班编辑 王洪春 校对 李世辉

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