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阿福是一名经验丰富的大盗趁著月黑风高,阿福打算今晚洗劫一条街上的店铺这条街上一共有 N 家店铺,每家店中都有一些现金阿福事先调查得知,只有当他同时洗劫了两家相邻的店铺时街上的报警系统才会启动,然后警察就会蜂拥而至
作为一向谨慎作案的大盗,阿福不愿意冒着被警察追捕的风險行窃他想知道,在不惊动警察的情况下他今晚最多可以得到多少现金?
输入描述: 输入的第一行是一个整数
输出描述: 对于每组数据输出一行。
我最早使用的Canu版本是1.6而现在已經是2.0,以往的改动基本上都是增加一些新功能提高组装准确性,以及一些默认参数的修改用于提高组装速度还有就是常规的bug修复。
例洳1.8版本的更新日志更改了Nanopore的错误率提高了10倍左右的组装速度,同时完整地支持了trio-binning
1.9版则是开始PacBio的HiFi数据同时极大的提高了相互比对的速度
對于这些修改,我们都可以直接将组装得到的contig用于后续的分析而2.0版本的更新则把我“坑”了
2.0做了许多的优化用来保证contig组装更长更准确,其中有一个就是在contig构建期间会检测bubbles, 防止他们打断杂合基因组
于是在我最近组装一个新的物种的时候就发现染色体明显偏大,我对此很不解直到我用新的Canu组装该物种的时候发现,前后两次组装结果中在bubbles这一栏中有明显差别1.8版本是0,2.0版本则是136约6M基因组大小。
我觉得这可能是个例于是我查看了之前所有组装物种的日志,发现bubble这一栏都是0(即便是杂合基因组)
这意味着,我们用2.0版本装的基因组不能无脑嘚用于下游的HiC而是需要先把bubble这部分序列给过滤掉,不然你的基因组是偏离实际值