细胞在正常代谢过程中因各种内、外因素如内源性活性氧等均可能导致DNA损伤若细胞累积的DNA损伤得不到正确修复,则可能引起基因突变、癌基因激活、抑癌基因失活及染銫体不稳定等并引发细胞衰老、凋亡、代谢等调控异常,最终可能导致包括肿瘤在内的各种疾病DNA保护机制使基因组免受环境因素或DNA代謝过程中自发产生的损伤破坏,这个过程主要包括DNA单链和双链断裂损伤修复DNA单链断裂通过错配修复、碱基切除修复和核苷酸切除修复途徑进行修复。DNA双链断裂通过非同源重组修复过程末端连接或同源重组修复过程重组修复途径进行修复
DNA不断受到各种内源性和外源性因素嘚损伤
同源重组修复过程重组修复作为核心的DNA损伤修复方式之一,它主要发生在细胞周期的S和G2期是维持基因组完整性确保遗传信息高保嫃传递的一种DNA修复机制。同源重组修复过程重组修复(homologous recombination repair,
ATM等发生突变、或BRCA1基因启动子发生甲基化、以及其他暂未明确的原因都会引起HRD,导致基因组不稳定肿瘤细胞往往会利用HRR使细胞免于凋亡,而当肿瘤细胞出现HRD同时PARP被抑制时,就会产生“合成致死”效应存在HRD的肿瘤对PARP抑制剂更敏感。大约有53.5%的卵巢癌患者存在同源重组修复过程重组修复缺陷(HRD)除了乳腺癌和卵巢癌外,HRD还存在于前列腺癌、胰腺癌、肝癌等多个癌种中
HRD相关基因检测的临床意义
有同源重组修复过程重组缺陷(HRD)的肿瘤细胞对铂类药物或PARP抑制剂更敏感,如奥拉帕利使用PARP抑制剂,可以使两种DNA损伤修复途径均出现障碍进而促进肿瘤细胞的凋亡,发挥更强的抗肿瘤作用即所谓的“合成致死”作用机制。HRD(+)患者与HRD(-)患者相比对铂类以及PARP抑制剂有更好的响应。目前已有三种PARP抑制剂(尼拉帕利、奥拉帕利、芦卡帕利)获批用于铂敏感复发卵巢癌的维持治疗2020年4月22日,FoundationOne CDx(F1CDx)卵巢癌报告中增加基因组杂合性缺失(gLOH)检测功能成为国内首个可以判断同源重组修复过程重组修复缺陷(HRD)的商用NGS产品。F1CDx通过覆盖22条染色体上324个基因的3500个SNP计算发生LOH的片段占整个基因组的比例。
然而仅仅用BRCA1/2作为HRD的划分标准是不足够的,因为HRR涉及的基因已知的就已多达数十个这些基因的异常也可能导致HRD表型。Pennington et al对390例卵巢癌的13个HRR相关基因进行胚系和体系突变测序发现携帶胚系或体系HRR相关基因突变的患者和铂类治疗敏感性以及良好的预后具有高度相关性。为此Turner和Ashworth等学者提出“BRCAness”的概念,描述无BRCA突变但具有和BRCA突变肿瘤类似表型的HRD。因此HRD的检测需要综合BRCA1/2和其他HR相关基因的检测以更有效地筛选铂类/PARPi适用人群。
同源重组修复过程重组修复(HRR)相關基因
目前有不同的方法来鉴定存在同源重组修复过程重组修复缺陷的BRCA野生型肿瘤患者具体方法有:
(1)记录大量基因组异常,即所谓的“基因组瘢痕”
(3)用DNA测序panel识别同源重组修复过程重组修复基因的点突变
近年来越来越多的证据表明HRR通路紊乱是多种类型癌症的基础,其复杂的过程涉及多种基因在多种肿瘤中发挥并扮演重要的角色,HRR能力强弱可能是体细胞突变及相应的多种类型肿瘤的主要诱因如BRCA1/2与乳腺癌,卵巢癌;RAD54与非霍奇金淋巴瘤;RECQL4与骨肉瘤和皮肤癌
- 禚昌龙, 陈维艳, 龙琦, 夏宜馨, 王灵巧, 杨桓, 曹佳, 周紫垣, 张爱华. 同源重组修复过程重组修复通路基因遗传变异与结直肠癌易感性的关联研究[J]. 第三军医大学学报, ): .