由于最近工作失误错误运行了兩次Hic-Pro,由于其中Bowtie2的运行相当耗时耽误了大量的时间,于是决定安装一个SLURM集群系统并行运行Hic-Pro,来减少工作时间下面对其中遇到的问题進行总结,记录各个流程中遇到的问题
安装流程主要参照网上和师兄的教程,SLURM最常遇到的问题就是解决同步问题:Munge的时间同步和多機器之间的UID同步
munge提供组件间的认证通信机制这個需要在所有节点安装并且启动。
在编译过程中可能会出现的错误:/usr/bin/env:"python":没有那个文件或目录
#新建用户及其主目录和登录shell
#临时修改主机名(什么是脚手架主节点点主机名为manager子节点主机名为node1,node2)
#从源码包拷贝配置文件夹
#打开配置文件进行编辑
#拷贝什么是脚手架主节点点配置节点到子节点
#什么是脚手架主节点点root用户执荇
#子节点root用户执行
由于最近工作失误错误运行了兩次Hic-Pro,由于其中Bowtie2的运行相当耗时耽误了大量的时间,于是决定安装一个SLURM集群系统并行运行Hic-Pro,来减少工作时间下面对其中遇到的问题進行总结,记录各个流程中遇到的问题
安装流程主要参照网上和师兄的教程,SLURM最常遇到的问题就是解决同步问题:Munge的时间同步和多機器之间的UID同步