铜仁历史悠久可以追溯到新石器时代。
秦代为黔中郡腹部地区
汉时改隶武陵郡，蜀汉时始有县治
唐置万安县，后改常丰县分属思州、锦州、黔州。
宋末元初设思州、思南两宣慰司
铜仁原名铜人，相传元朝时有渔人在铜岩处潜入江底得铜人三尊。元代设置“铜人大小江蛮夷军民长官司”隶属思南宣慰司。明永乐十一年撤思州、思南宣慰司于今境地设铜仁、思南、石阡、乌罗4府，均隶属于由此而设置的贵州布政使司明正统彡年（公元1438年）废乌罗府，其大部并入铜仁府铜仁由此得名。
民国元年（公元1912年）撤铜仁县（治所今江口县）并入铜仁府（治所今铜仁市）
民国2年（1913年）改铜仁府为铜仁县（治所今铜仁市）；同时，改思南府为思南县改石阡府为石阡县，改松桃直隶厅为松桃县另外，恢复原铜仁县（治所今江口县）改名江口县安化县改名德江县，以原思南府沿河佑溪吏目驻地设沿河县以原铜仁府省溪吏目设省溪縣（今万山特区）。玉屏县、印江县建置不变
民国3年（1914年）以原铜仁县正大营县丞驻地设正大营分县，隶属松桃县兼管；以原四十八溪主薄驻地设四十八溪（今甘龙口）分县隶属松挑县兼管。
民国24年（公元1935年）6月经国民政府军事委员会委员长行营核准，在贵州省建立11個行政督察区其中第六行政督察区专员公署驻思南，辖思南、德江、印江、沿河、石阡等县第五行政督察区专员公署驻铜仁辖铜仁、江口、松挑、玉屏、省溪等县。
民国25年（1936年）1月正大营分县并入铜仁县，甘龙口分县并入松桃县同年3月，全省缩编为8个督察区第六督察区专员公署驻铜仁，辖铜仁、江口、松桃、玉屏、石歼、省溪、思南、德江、印江、沿河、后坪（治所今沿河县后坪乡）13县
民国26年（1937年）11月，督察区重新设置德江、后坪2县划属第五督察区（治所今遵义市），其余9县隶属第一督察区（治所今镇远县）
民国30年（1941年）撤省溪县，辖地分别并入铜仁、玉屏2县；撒后坪县辖地分别并 入沿河、务川2县。
民国32年（1943年）2月全省改设6个行政督察区。第六督察区專员公署驻铜仁辖铜仁、江口、玉屏、松桃、印江、石阡、思南、德江、沿河9县。
1950年1月12日铜仁地区全境解放，当年设铜仁专区专员公署驻铜仁县，辖铜仁、玉屏、松挑、江口、印江、石阡、思南、德江、沿河9县
1952年，四川省秀山县九江乡划归贵州省松桃县
1956年9月撤销松桃县，设立松桃苗族自治县1958年12月撤销玉屏、江口二县，并入铜仁县1961年8月恢复玉屏、江口两县。
1966年12月设立万山特区1968年9月撤销，1970年8月恢复万山特区
1979年1月撤销铜仁地区革命委员会正式设立铜仁地区行政公署（筒称行署），作为贵州省人民政府行政派出机关的现行建制
1983姩9月7日国务院批准撤销玉屏县建立玉屏侗族自治县，原行政区域不变；1986年10月7日国务院批准撤销沿河县设立沿河土家族自治县，原行政区域不变；1986年12月13日国务院批准撤销印江县，设立印江土家族苗族自治县原行政区域不变。1987年8月21日国务院批准撒销铜仁县设立铜仁市，原行政区域不变
1984年1月将人民公社改为乡，通过建乡建镇调整全区乡级行政区划分60个区。
1987年新建民族乡79个乡级建制为60个区，10个区级镇区（镇）下辖315个乡、22个乡级镇，83个民族乡
1991年全区通过“建并撤”并报经省人民政府批复，自此开始建置为39个乡、56个民族乡、69个镇、4个街道办事处
2011年10月22日，撤消铜仁地区设地级铜仁市撤消原县级铜仁市设碧江区，以原县级铜仁市行政区域为新的碧江区行政区域；撤消萬山特区设铜仁市万山区。
截至2013年铜仁市辖碧江、万山区2区，江口、石阡、思南、德江、玉屏、印江、松桃、沿河8县下设169个乡镇（含办事处），175个居委会、2699个村委会市政府驻碧江区花果山中路8号。
