安装Caffe的Python wrapper时出现问题的解决方法
安装Caffe的Python wrapper时出现问题的解决方法
[摘要：Caffe的装置能够参考我之前的文章caffe装置指北（Ubuntu13.04 x86) 那篇文章是之前文章中前置硬件装置中python的拓展，若是已依照之前的装置好了，能够先正在caffe-master目次下履行 $make py]
Caffe的安装可以参考我之前的文章caffe安装指南（Ubuntu13.04 x86)
这篇文章是之前文章中前置软件安装中python的拓展，如果已经按照之前的安装好了，可以先在caffe-master目录下执行
$make pycaffe如果提示不能make pycaffe
可以先执行
$make clean（以上步骤也可以放在最后进行）
安装其他的库需要的只是执行
$ sudo pip install -r /path/to/caffe/python/requirements.txt
Cython&=0.19.2
h5py&=2.2.0
ipython&=1.1.0
leveldb&=0.191
matplotlib&=1.3.1
networkx&=1.8.1
nose&=1.3.0
numpy&=1.7.1
pandas&=0.12.0
protobuf&=2.5.0
python-gflags&=2.0
scikit-image&=0.9.3
scikit-learn&=0.14.1
scipy&=0.13.2
但是我在安装中碰到了一些问题，导致无法正确安装，因此，我是在后续的程序运行中遇到了需要的库再独立安装，主要问题出现在Cython,scikit-image和scipy上
1.Cython需要在scikit-image之前安装
$ sudo pip install cython(python缺少的库都可以用pip install安装)
这里出现了第一个问题：
File &/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/install_egg_info.py&,
line 5, in
from setuptools.archive_util import unpack_archive
File &/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/archive_util.py&, line 15, in
from pkg_resources import ensure_directory, ContextualZipFile
ImportError: cannot import name ContextualZipFile
经过了千辛万苦翻墙搜索后得到了解决方法
这个问题实际上是处在setuptools上，从上面的traceback中也可以发现，一位友好的国际友人提供了修改过的setuptools安装包&setuptools-5.4.1.zip
（https://bitbucket.org/pypa/setuptools/issue/234/setuptools-import-error-of-class）
解压之后在目录中执行
$ sudo python setup.py install即可安装。
安装完后，上述问题顺利解决，遇到第二个错误提示：
File &/usr/lib/python2.7/dist-packages/pkg_resources.py&, line 594, in resolve&&
raise DistributionNotFound(req)
pkg_resources.DistributionNotFound: distribute
解决方法是：安装distribute包
$ wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py $ python distribute_setup.py(/questions//easy-install-and-pip-broke-pkg-resources-distributionnotfound-distribute-0-6)
2.安装scikit-image
$sudo pip install scikit-image提示的错误是：
ImportError: You need `six` version 1.3 or later.
$sudo pip install six
发现已经安装了，那么问题就是版本没到1.3以上
解决方法：
$sudo pip install six==1.3
3.安装scipy
$sudo pip install scipy
错误提示：
building 'dfftpack' library
error: library dfftpack has Fortran sources but no Fortran compiler found
也就是没有安装gfortran编译器
解决方法：
$sudo apt-get install gfortran一般来说这里是可以直接解决的，但是由于网络原因，提示404 not found，在尝试了多种方法后都没有解决。
观察运行过程，发现需要安装的包括：
gfortran-4.7_4.7.3-1ubuntu1_amd64.deb
gfortran_4.7.3-1ubuntu10_amd64.deb
libgfortran-4.7-dev_4.7.3-1ubuntu1_amd64.deb
从Google上搜索可以很容易找到下载，下载后
$sudo dpkg -i *.deb即可安装，这三个包有前置关系，安装时注意看提示即可。
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【泡咖啡1】linux下caffe编译以及python环境配置手记
时间： 编辑：77695 来源：本站整理
caffe是一个深度学习的库，相信搞深度学习的话，不是用这个库就是用theano吧。要想使用caffe首先第一步就是要配置好caffe的环境。在这里，我主要说的是在debian的linux环境下如何配置好caffe的库。因为python编写程序比较方便，在文章最后，我还会具体说明如何配置python环境。本文章为本人原创。非盈利性质网站转载请在文章开头处著名作者：77695，来源/cj695/。盈利性质网站转载请与作者联系，联系方式在文章后面。如未联系，本人将通过一切可能且合法的途径追缴相应稿酬。请在转载时保留此声明。 1、前期准备 首先从github上下载好caffe库：/BVLC/caffe，解压，得到这些东西
使用这一句话创建一个makefile.config的副本
接下来就是修改makefile.config，在这个文件里面对应的注释讲的很清楚，需要哪一项，吧对应那一项前面“#”去掉就好了
先拿make all测试，提示错误如下：
make: protoc：命令未找到make: *** [.build_release/src/caffe/proto/caffe.pb.h] 错误 127 2、编译以及安装protoc 那就下载protobuf吧，在github下载，解压/google/protobuf：
运行$ ./autogen.sh
原来先要安装curl：额，貌似curl安装不成功那就跳过吧。因为curl祈祷的作用就是下载文件，但/files/gtest-1.7.0.zip这个东西还是要下，那就直接下载吧，可能需要科学上网，这个方法那就八仙过海各显省通，我就不赘述。
下载好以后把压缩包移动过去。
找到对应位置注释掉curl
再次运行，提示错误
./autogen.sh: 40: ./autogen.sh: autoreconf: not found
原因是没安装 automake 工具
运行命令安装：sudo apt-get install autoconf automake libtool
再一次./autogen.sh，成功！然后依次运行以下命令$ ./configure
$ make check
$ make install执行完make check以后出现：就说明没什么问题了，就可以继续执行make install
执行完以后切换到caffe目录，先make clean一下，接着make all
还是提示找不到库，
3、安装一系列依赖库
再执行安装一些库：sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libboost-all-dev libhdf5-serial-dev，稍等
再执行make clean，接着make all，提示：
./include/caffe/common.hpp:5:27: fatal error: gflags/gflags.h: 没有那个文件或目录。说明protobuf的库已经差不多了。
4、安装gflags
这里继续安装gflags：/schuhschuh/gflags/archive/master.zip 下载。解压cd gflags-master
mkdir build && cd build
export CXXFLAGS="-fPIC" && cmake .. && make VERBOSE=1
sudo make install在执行第三句话的时候可能会提示版本较低，直接在这里http://www.cmake.org/install/下载最新版本的cmake就好了（下载.sh的文件直接运行就可以了）。要配置一下环境变量
然后接着执行下面两条命令，就好了。弄完之后继续切换到caffe目录，先make clean一下，接着make all
./include/caffe/util/mkl_alternate.hpp:11:19: fatal error: cblas.h: 没有那个文件或目录compilation terminated.
说明gflag安装成功了，
5、编译安装ATLAS
接下来开始搞定cblas的问题。BLAS（Basic Linear Algebra Subprograms，基础线性代数程序集）是一个应用程序接口（API）标准。他的实现有很多，caffe用的是其中的三种实现ATLAS, MKL, or OpenBLAS.这里我准备使用ATLAS：http://sourceforge.net/projects/math-atlas/files/ 先下载，解压。按照官方文档写的，依次执行如下命令
首先选择高性能cpu模式：/usr/bin/cpufreq-selector -g performance然后在ATLAS目录下建立文件夹
mkdir Linux_C2D64SSE3
# create BLDdir
cd Linux_C2D64SSE3
# enter BLDdir
../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=2800 -Fa alg -fPIC --with-netlib-lapack-tarfile=/home/haiyu/Programs_Install/lapack-3.5.0.tgz --prefix=/usr/local/atlas粗体参数需要根据个人系统修改：-b 指定编译出库的类型（32位库还是64位库）&&&&&& -D c -DPentiumCPS 是指定你的CPU的时钟频率，可以通过 grep MHz /proc/cpuinfo 得到&&&&&& -Fa alg -fPIC 得到与位置无关的代码，生成动态的共享库&&&&&& --prefix 为安装路径&&&&&& --with-netlib-lapack-tarfile 则是lapack压缩包路径
make build
# tune & build lib
make check
# sanity check correct answer
make ptcheck
# sanity check parallel
# check if lib is fast
make install
# copy libs to install dir
这里还需要一个lapack的库，在这里下载http://www.netlib.org/lapack/，下载之后直接把/home/whaley/dload/lapack-3.4.1.tgz替换成对应的路径就好了
在执行../configure的时候，会提示gfortran:命令未找到，直接用apt-get安装即可。然后make build之后就可以休息去了。等一个小时再过来看吧。
ok。。现在是第二天。昨天晚上凌晨3点的时候终于看到它提示DONE了。这速度。太！“快”！了！继续执行接下来的命令几个可以忽略的就忽略了，然后再切换到CAFFE目录make clean/all，依旧提示
但这个时候在atla的prefix指定的安装路径下已经有include/cblas.h
执行这两条，添加目录到include环境变量
6、安装lmdb
接着make，提示错误lmdb没装
git clone git://gitorious.org/mdb/mdb.git&
cd mdb/libraries/liblmdb&
make && make install&
运行完，再回到caffe目录编译
AR -o .build_release/lib/libcaffe.aLD -o .build_release/lib/libcaffe.so/usr/bin/ld: cannot find -lcblas/usr/bin/ld: cannot find -latlascollect2: error: ld returned 1 exit status
7、安装其他依赖包
解决办法：安装这些包
apt-get install libatlas-devapt-get install liblapack-devapt-get install& libatlas-base-dev
又提示这个错误.build_release/lib/libcaffe.so: undefined reference to `google::protobuf，重新编译protobuf
make uninstallmake clean./configure --prefix=/usrmakemake check
make install搞定，返回caffe，编译成功！！！！！！！！！！！！！此处有掌声！！！！！
然后把目录添加到PYTHON环境变量就行了
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/home/cj695/protobuf/python/最后还要找到protobuf的Python目录python setup.py build
python setup.py test
python setup.py install安装一下激动人心的一颗来了！！！！！！！！！！！打开python，import caffe。。这一刻，我哭了！！！！！！！！！！！！！
8、总结一下耗费两天时间，卡时间比较多的主要有两个地方，首先查错一定要从上往下查。基本上最上面的错误才是最根本的错误；其次，在安装过程中对配置做过的修改一定要记清楚，别自己把安装路径改了结果还不知道是怎么回事。
另外，如果在安装gflags的时候出现问题，可以实验一下用apt-get安装gflag，命令如下：
sudo apt-get install python-gflags
caffe的配置大概也就这些内容，希望这篇文章能够对你有所帮助
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然后执行如下命令安装编译caffe python wrapper 所需要的额外包sudo pip install -r /path/to/caffe/python/requirements.txt在执行上述命令时， 会报错导致不能完全安装所有需要的包。 可以按照官方建议安装anaconda包。 在anaconda官网下载.sh文件，执行，最后添加bin目录到环境变量即可。2.&/Linux/34p5.htm如果之前没有用python接口直接编译的sudo make pycaffe
编译失败（.build_release/src/caffe/proto/caffe.pb.h:17:2: error: #error This file was old ）则需要重新编译
sudo make clean
sudo make all
sudo make test
sudo make runtest
然后再执行
sudo make pycaffe 由于要使用caffe的python接口，然而import caffe 总是出错。这里我使用的是anaconda包。首先要保证make pycaffe 能通过，然后要安装&qtconsole（显示图片，绘制曲线等需要）现在我们可以安装Qt了:sudo apt-get install libqt4-core libqt4-gui libqt4-dev qtconsole有一些附加的包,即ZMQ和Pygments库:sudo apt-get install libzmq-dev sudo pip install pyzmq sudo pip install pygments 具体参考/Linux/34p6.htm安装成功后使用下面命令测试下：ipython qtconsole --pylab=inline
在这里编写代码测试，写完一行后ctrl+Enter键可以写多行。写完后按回车键如果没有报错，那么恭喜你，你就可以使用python的接口了。如果import caffe 出错，出错的可能如下。1...../libm.so.6:version 'GLIBC_2.15'not find ......找到这个文件所在位置：find& /& -name libm.so*&&&&&& (这个命令表示从/ 目录下开始查找)找到后切换到文件所在目录使用sudo mv libm.so& libm.so_backsudo mv libm.so.6& libm.so.6_back2.No module named google.protobuf.internal这说明你没有添加google.protobuf.的位置sys.path.append('/usr/lib/python2.7/dist-packages/')3.添加了还是出错can’t import&symbol_database 等类似错误TypeError: __init__() got an unexpected keyword argument ‘oneofs’ 等错错误这些错误是google.protobuf 版本问题所导致的。解决办法：下载protobuf-2.6.0切换到/usr/lib/python2.7/dist-packages/ 目录下& 先将google 文件夹备份sudo mv google google_back将其protobuf-2.6.0/python 目录下的google文件拷贝到/usr/lib/python2.7/dist-packages/目录下即可。这里需要将你刚备份的文件google_back/protobuf/ 目录 descriptor_pb2.py& 拷贝到google/protobuf/的目录下。
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