用替你还填写的资料多不多,繁琐的 英文么

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我用R软件的metafor Package进行meta analysis,如果我只知道每项研究的RR值及其95%的可信区间,请问metafor package可否对其进行meta分析。如果可以,应该怎么做?不甚感谢!!
载入中......
shuaihandsome 发表于
可以做的怎么做呀,求指教
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应用stata软件mvmeta程序包实现网状meta分析
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【原创】手把手讲授如何用R软件做单个样本率(患病率、检出率、低估率、标化率)的meta分析&[精华]
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那请问生存率(比如已知各个study的3年,5年生存率)能用metaprop 进行合并吗?
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请问R软件亚组分析怎么做啊? 命令是什么?
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mike305 手把手讲授如何用R软件做单个样本率PS :告诉大家一个好消息,时隔两年后,师妹把这篇贴子整理成论文发表在&&循证医学&&杂志上2013年16卷第3期上,现在把电子版贴出来,学习一下(不要丁当)1,
R软件的安装:大家可以从R官网上下载最新版本的R软件(R 2.13.1)网址如下:安装好后,在电脑中的其它盘(我是选的G盘)建一个Rworkplace文件夹,同时在桌面图标上单击右键选属性:请问R软件怎么做亚组分析啊,命令是什么,能说的详细点吗,我之前的步骤全是按照你教的来做的。还有一个问题就是,我想在R软件里面编辑数据,怎么打开数据编辑表?
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好帖,谢谢分享,学习了
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楼主,你好,我用你之前的一篇贴,STATA软件做了单个率的合并,出现的是ES值,发现您用R软件得到的是P值,那么这两个软件都可以做单个率合并吗?如果要发表文章,这两种方法都可以吗?谢谢楼主!
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亚组分析:在forest(byvar=变量名,)
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非常感谢楼主的详细指导。我想问一下,是不是所有的数据都需要进行5种数据转换后在计算呢?是否选择I^2最小的那一种形式就行了呢?
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mike305 手把手讲授如何用R软件做单个样本率PS :告诉大家一个好消息,时隔两年后,师妹把这篇贴子整理成论文发表在&&循证医学&&杂志上2013年16卷第3期上,现在把电子版贴出来,学习一下(不要丁当)1,
R软件的安装:大家可以从R官网上下载最新版本的R软件(R 2.13.1)网址如下:安装好后,在电脑中的其它盘(我是选的G盘)建一个Rworkplace文件夹,同时在桌面图标上单击右键选属性:
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请问如何用r软件做单组率的亚组分析呢,例如性别、疾病类型、地区等,数据如何输入,是按照连续性变量也不太合适吧?
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楼主,你好。我也是中南大学毕业的,我这里遇到个问题,就是如何合并annual event rate,因为单个研究的annual event rate是降随访时间考虑进去了的,像这类数据的率的合并该怎么做。请教了~~~
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楼主的方法非常非常好,非常感谢楼主将方法分享出来。但是我在重复楼主动作的时候,有几个地方是无法成功的,现简要补充如下。1.在读取rate文件时。楼主的程序不知道为什么读取数据不成功(刚才成功了),好奇怪,不同时间效果怎么不一样。。。这是我后来用的程序
rate&-read.csv(&rate.csv&)
直接照着楼主给的文献抄的。。。2.在运用分析程序时候,显示错误: 没有&metaprop&这个函数。这个问题主要是因为没有加载meta程序包导致的,因为我英语水平不高,用的是中文软件,故而把每个能添加meta程序包的地方都试了一下。发现了加载meta程序包的简单方法,点击程序包窗口——选择加载程序包——点击meta分析,就可以了。最后还是感谢楼主这个方法分享出来,昨天看完楼主的帖子才动了要使用r软件的念头,不妥之处,望请海涵。
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不好意思哦,菜鸟啊,哪位能帮忙解释一下这个是怎么回事啊?打不开csv文件啊
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我下载不了这个R软件
能不能给我发到邮箱
最近在做这个
用STATA按你说的步骤完成了但没解决P=0或1时的情况
我看你说R软件可以解决这个问题
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mike305 接下来,在R软件中输入如下命令:a&-read.csv(&rate.csv&),读取数据继续输入如下命令:metarate&- metaprop(event,n, study,data=a,sm=&PLOGIT&,incr=0.5, allincr=FALSE,addincr=FALSE,comb.fixed=TRUE,comb.random=TRUE,title=&&,complab=&&, print.byvar=TRUE, warn=TRUE)R软件要是没有提示就是警告就说明没有错,简单介绍下这个命令,R软件对于率的meta有一个专门的函数:metaprop用于单个样本的率,仅需要每个研究的发生数(event)和样本量(n)就可以了,sm表示估计样本率的方法,因为单个率可能为合种不同的分布所以要对数据转换,使之正态什么的,R软件中关于样本率的估计方法有四种,分别是:sm=”PFT”
Freeman-Tukey Double arcsine transformation(Freeman-Tukey双重反正弦转换)sm=”PAS”
Arcsine transformation(反正弦转换)sm=”PRAW”
Raw, i.e. untransformed, proportions(没有转换的原始率)sm=”PLN”
Log transformation(对数转换)sm=”PLOGIT”
Logit transformation(logit转换)至于该选哪个方法,个人认为可能要根据数据的性质进行判断,也可以都试一下,哪个算出的异质性小,就选哪个,这里也请高手解答一下.文中我选的是sm=”PLOGIT”
Logit transformation(logit转换)之后的一些命令我说不多解释了,我会上传一个官方的metaprop手册,大家可以自已阅读.接下就我们就来看看森林图的结果,输下如下命令: forest(metarate)回车,如下图因为森林图里面没有数据合并后的P值等相关数据,要了解这样的数据,请在命令窗口中填入summary(metarate),即可出现相关数据。如下图。接下来,输入命令funnel(metarate),看看漏斗图(一般是大于10个研究才需要画这个图) 你好,老师,非常好的帖子!我也正在做一个率的meta, 有两点问题想请教您?1.请问R软件分析结果怎么才能不同时显示固定效应模型和随机效应模型的?2. 有没有什么办法让率在森林图中显示为百分位数形式,而不是小数形式?谢谢,感激不尽。
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转换后的正态性检验如何完成,按照《在R软件中实现单个率的Meta分析》中的做法shapiro.test(rate$p);shapiro.test(rate$log);shapiro.test(rate$logit);shapiro.test(rate$arcsin);shapiro.test(rate$darcsin)出来都是这个“错误: 不是所有的is.numeric(x)都是TRUE”
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我下载的最新版本的R软件
请问老师们 每次作分析时都要重复下载模块和加载模块吗
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mike305 接下来,再输入如下命令metabias(metarate)进行Begg检验,(如果是最新的版本,可得要大于10个研究才能出来这个结果)得到:接下来,进行Egger检验,命令如下:metabias(metarate, method=&linreg&)接下来, 在R软件中输出Egger漏斗图,命令如下:metabias(metarate, method=&linreg&, plotit=TRUE) 以上就是所有操作过程,大家可以自已做做,如果贴子对你有帮助,请投上一票,顶一下贴子。 于湘雅老师 我按照您的方法做的(最新版本的R软件) 为什么输入的这三个命令 但是结果却是一样的呢
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abc 请问如何用r软件做单组率的亚组分析呢,例如性别、疾病类型、地区等,数据如何输入,是按照连续性变量也不太合适吧? 亲 你的问题解决了吗 做亚组分析 回归分析 等的命令是什么 谢谢 还有如果进行各个率的合并时用未转换时metarate&- metaprop(event,n, study,data=rate,sm=&PRAW&,incr=0.5,allincr=FALSE, addincr=FALSE,title=&&)有异质性 但是经过Logit transformation(logit转换)命令为:metarate&- metaprop(event,n,study,data=a,sm=&PLOGIT&,incr=0.5,allincr=FALSE,addincr=FALSE,comb.fixed=TRUE,comb.random=TRUE,title=&&,complab=&&, print.byvar=TRUE, warn=TRUE)没有异质性啦 以后的分析怎么进行 谢谢
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R软件每次需要重复加载metafor等软件,但不用重复下载。每次打开软件后,Library(“metafor”)再输入相应命令就OK了。。。
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显示的是错误:没有“metatrop”这个函数
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楼主你好,看了你的帖子收获太大了。但是我还有一个问题,要怎么森林图上的小数做成百分数表示的啊
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为什么按照文献中的命令复制以后,也没有错误提示,森林图,漏斗图不出来???没有图,也没有数据
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非常实用,感谢楼主
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非常好用,结果也出来了。但是因为研究数量只有8组,偏倚分析需要十组才可以,请教怎么样修改设置出偏倚的结果,多谢,着急用呢
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是不是每次打开软件的时候就得重复加载那些package啊?
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doczxh 非常好用,结果也出来了。但是因为研究数量只有8组,偏倚分析需要十组才可以,请教怎么样修改设置出偏倚的结果,多谢,着急用呢同求相关方法
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doczxh 非常好用,结果也出来了。但是因为研究数量只有8组,偏倚分析需要十组才可以,请教怎么样修改设置出偏倚的结果,多谢,着急用呢 我已找到,在楼主那篇文章里面有说的,请细读
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学到了好多,楼主太厉害了~按照楼主给的方法演示了一遍,发现运行命令时只可以显示森林图,漏斗图与之后的Egger漏斗图就不显示了,这是为什么呢?求楼主解答!
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mark,学习了
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楼主太棒了,最近也很纠结这个东东,突然看到了曙光。我也是菜鸟,按照楼主的步骤,怎么得出来这个结果,请教Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or'help.start()' for an HTML browser interface to help.Type 'q()' to quit R.& utils:::menuInstallPkgs()--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---trying URL 'https://mirrors.tuna./CRAN/bin/windows/contrib/3.2/meta_4.3-0.zip'Content type 'application/zip' length 436067 bytes (425 KB)downloaded 425 KBpackage ‘meta’ successfully unpacked and MD5 sums checkedThe downloaded binary packages are in
C:\Users\Administrator\AppData\Local\Temp\RtmpqSQo6W\downloaded_packages& local({pkg &- select.list(sort(.packages(all.available = TRUE)),graphics=TRUE)+ if(nchar(pkg)) library(pkg, character.only=TRUE)})Loading 'meta' package (version 4.3-0).& a<-read.csv(&rate.csv&)&
metarate<metaprop(event,n,study,data=a,sm=&PLOGIT&,incr=0.5,allincr=FALSE,addincr=FALSE,comb.fixed=TRUE,comb.random=TRUE,title=&&,complab=&&,print.byvar=TRUE,warm=TRUE)& forest(metarate)Error in forest(metarate) : object 'metarate' not found
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飞飞MMMM 楼主你好,看了你的帖子收获太大了。但是我还有一个问题,要怎么森林图上的小数做成百分数表示的啊 同问,您的问题解决了吗?
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